Публикации по теме 'bioinformatics'


UNIX для медико-биологических наук — От чашек Петри к командным строкам — Часть 1
Открытие нового мира через интерфейс командной строки (CLI) Более десяти лет назад, работая над докторской диссертацией. по молекулярной биологии и генетике я познакомился с «волшебным» миром Unix/Linux. Я предполагал проводить большую часть своего времени с машинами для ПЦР и чашками Петри, но вместо этого меня привлекали строки кода и постукивание по клавиатуре. Знакомство с Unix/Linux было не просто академическим; это изменило направление моих исследований и карьеры. В..
YAPC::Europe 2016 Спикеры: Эндрю Йейтс
Проект Ensembl ( http://www.ensembl.org ), в настоящее время размещенный в EMBL-EBI, был основан в 1999 г. и был создан для интерпретации геномных данных, полученных в рамках международного проекта Геном человека . Ensembl был создан с использованием Perl в качестве основного языка программирования. «Здесь мы представляем краткий обзор области биоинформатики, EMBL-EBI, проекта Ensembl, инструментов, разработанных Ensembl, и того, как они повлияют на нашу повседневную жизнь. Мы также..
Интеграция Python с биологией:
Интеграция Python с биологией: 1. Биоинформатика: Python имеет мощные библиотеки, такие как Biopython, которые предоставляют инструменты для обработки биологических данных, таких как последовательности ДНК и белков. Исследователи могут использовать эти библиотеки для анализа генетической информации, выравнивания последовательностей и прогнозирования структуры белков. 2. Анализ данных. Библиотеки обработки данных Python, такие как Pandas и NumPy, широко используются в биологии для..
Как скачать файлы FASTA/FASTQ?
Поздравляю! Вы пережили ужасную часть, с которой борются большинство новичков. Похлопайте себя по спине :) Теперь приступим к делу. Мы собираемся загрузить биологические данные из базы данных NCBI. Мы будем использовать данные статьи https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6411972/ для сегодняшней демонстрации. Перейдите на веб-сайт NCBI и введите регистрационные номера. Для этого конкретного примера данные хранятся в BioProject. После того, как вы нашли файл, скопируйте..
Как ИИ помогает биоинформатикам помочь людям выжить
Биоинформатика — это область, сочетающая использование информатики, математики и техники для анализа и интерпретации биологических данных, таких как последовательности ДНК и белков, а также генетической информации. А биоинформатик — это ученый, который понимает основную механику биоинформатики или, что более реалистично, один из аспектов биоинформатики (геномика, прогнозирование структуры белков, филогенетические модели и т. д.). . Искусственный интеллект (ИИ) приобретает..
10 летних школ по машинному обучению, искусственному интеллекту и не только
Для многих студентов лето — это отдых и развлечения. Однако, если вы все еще жаждете знаний после многих лет обучения, почему бы не принять участие в летней школе? Если в вашем обычном учебном плане отсутствует какая-либо тема или вы хотите углубить свои знания в области машинного обучения, искусственного интеллекта, глубокого обучения и обучения с подкреплением, а также науки о данных, вот выбор лучших летних школ 2022 года. Летняя школа машинного обучения в Оксфорде Даты:..
tSNE переходит в PCA
Математическая статистика и машинное обучение для наук о жизни tSNE переходит в PCA В большом недоумении Это шестнадцатая статья из колонки Математическая статистика и машинное обучение для наук о жизни , в которой я пытаюсь просто объяснить некоторые загадочные аналитические методы, используемые в биоинформатике и вычислительной биологии. В моем предыдущем посте tSNE против UMAP: глобальная структура я затронул предел большого недоумения как потенциального способа для..