Итак, сегодня я продолжу свой путь к биоинформатике с помощью машинного обучения. И я попытаюсь выполнить самую основную задачу биоинформатики, а именно преобразование последовательности ДНК в белок. Кроме того, это слишком усложняет задачу, мы можем просто построить словарь для сопоставления значений, как это сделал Виджини Маллаваараччи в этом посте . Также обратите внимание, что мы собираемся предварительно обработать последовательность ДНК / белка в векторах, если вы не знаете,..

Рекуррентные нейронные сети (RNN), такие как долговременная кратковременная память (LSTM) или Gated Recurrent Units (GRU), в последние годы доминировали в области моделирования последовательностей. В наиболее эффективных моделях используется архитектура кодер-декодер в основном в сочетании с механизмами внимания. В 2017 году Васвани и др. представили The Transformer, модель последовательности, которая опирается исключительно на механизмы внимания без каких-либо операций повторения и..

Взгляд на роль данных секвенирования следующего поколения в улучшении лечения рака Циркулирующая внеклеточная ДНК, сокращенно вкДНК, представляет собой фрагментированную ДНК, выбрасываемую в кровоток всеми клетками организма. У больных раком опухолевые клетки также выделяют свою фрагментированную ДНК в кровь. Эта ДНК из раковых клеток называется циркулирующей опухолевой ДНК, сокращенно цтДНК. в последнее время в центре внимания онкологических исследований была ктДНК, поскольку она..