Вопросы по теме 'vmd'
Не удается объединить файлы dcd в VMD с помощью инструмента catdcd
У меня есть набор файлов dcd, которые я хочу объединить в один (длинный) файл dcd. Я вставил в VMD Tkconsole (версия VMD: 1.9.2) следующий код:
catdcd -o output.dcd -i indexFile.ind input1.dcd input2.dcd input3.dcd
и у меня была следующая...
2260 просмотров
schedule
11.11.2022
Загрузите несколько кадров в файл psf в VMD
Как я могу открыть файл psf в vmd, а затем загрузить для этого файла psf несколько кадров (файлы dcd), используя только линейные команды? У меня есть сотни файлов DCD, и я не хочу делать это вручную.
1103 просмотров
schedule
17.03.2023
Установка VMD с поддержкой Python на MAC
Я пытался установить VMD1.9.2 на Macbook с поддержкой Python, но не смог. Мне кажется, что упакованный файл .dmg для VMD поставляется без поддержки Python. Я использовал команду vmdinfo options , чтобы найти параметры, с которыми установлен мой...
554 просмотров
schedule
23.04.2023
Вложенный цикл Tcl: неправильно # аргументы: должны быть для начала проверки следующей команды
Я пытаюсь выполнить вложенный цикл, но получаю сообщение об ошибке «неправильный # аргумент: должно быть «для начала проверки следующей команды». Что это значит, и может ли кто-нибудь помочь мне найти, что не так с моим кодом ?
Примечание. Я...
3455 просмотров
schedule
30.12.2023
пытаясь выяснить события проникновения в каждую пору белка AQP, встроенного в липидный бислой, через VMD
Мой проект основан на анализе моделирования методом МД системы, содержащей водяную камеру и липидный бислой, содержащий встроенный в него аквапорин. В этой системе выполняется моделирование с временным шагом 150 нс для изучения анализа проникновения...
43 просмотров
schedule
14.06.2023