Когда я конвертирую файл vcf в формат ped (с помощью vcftools или с преобразователем vcf в ped 1000G), я сталкиваюсь с проблемой, что идентификаторы вариантов, у которых нет идентификатора dbSNP, получают позицию базовой пары этого варианта. как...

У меня есть список файлов VCF определенной этнической принадлежности, такой как американские индейцы, китайцы, европейцы и т. д. По каждой национальности у меня есть около 100+ файлов. В настоящее время я вычислил метрики VARIANT QC , такие как...