Вопросы по теме 'survival'
Как смоделировать взаимодействие ковариаты со временем, когда предположение о пропорциональности нарушается при анализе выживаемости в R
В R, как лучше всего включить член взаимодействия между ковариатой и временем, когда тест пропорциональности (с coxph) показывает, что предположение пропорциональности в модели Кокса нарушено? Я знаю, что вы можете использовать либо страты, либо...
1970 просмотров
schedule
23.07.2022
Петля Survdiff - значения P
Я пытаюсь подмножить свой текущий фрейм данных новым фреймом данных, в котором перечислены гены, которые я исследую, в одном столбце и p-значения в другом (для каждого гена).
У меня есть кадр данных с именем m3, который выглядит следующим образом:...
259 просмотров
schedule
12.04.2023
Как подогнать модели выживания хрупкости в R
Поскольку это такой длинный вопрос, я разбил его на 2 части; первый - это просто основной вопрос, а второй - подробности того, что я пытался сделать до сих пор.
Вопрос - Короткий
Как вы вписываете в R модель индивидуального выживания? В...
2147 просмотров
schedule
25.06.2022
Фиксированный коэффициент/смещение в модели Fine&Gray с поправкой на конкурирующий риск (FGR)
Я хочу использовать конкурирующую модель Fine&Gray с поправкой на риск, включая компенсацию. В других типах моделей я привык просто вводить >offset(x), что добавит смещение с коэффициентом 1. Я попытался сделать то же самое, используя функцию FGR из...
113 просмотров
schedule
29.08.2022
Предоставление фрейма данных и столбцов в отдельных аргументах
Я умею рисовать кривые выживания (сделанные пакетом survival ) autoplot из ggfortify . Здесь я использую фрейм данных ovarian , также из пакета выживания.
library(survival)
library(ggfortify)
autoplot(survfit(Surv(ovarian$futime,...
46 просмотров
schedule
13.03.2023
Построить кривую выживаемости с зависящей от времени ковариатой и изменяющимся во времени коэффициентом
Я хочу, чтобы код генерировал кривые выживания в среде с обоими
зависящие от времени ковариаты и
коэффициенты, меняющиеся во времени.
Цель состоит в том, чтобы продемонстрировать, как метод выставления счетов влияет на срок действия полиса...
191 просмотров
schedule
24.05.2022
Как преобразовать мои данные в формат процесса подсчета с указанием времени начала и остановки для усечения интервала в R?
Я хотел бы смоделировать повторяющееся событие с субъектами, которые входят в группу риска и выходят из нее в течение периода наблюдения за исследованием.
У меня есть данные о периодах без риска (даты начала и окончания), когда субъект не может...
471 просмотров
schedule
26.05.2022
Нан и Инф в обзоре модели survreg
Я использую анализ выживания для оценки относительного расстояния (вместо времени, как это обычно бывает со статистикой выживания) до того, как произошло данное событие. Поскольку набор данных, с которым я работаю, довольно большой, вы можете...
323 просмотров
schedule
26.12.2022
Настройка масштаба y в панели терминала на графике ctree выживания
Я использую ctree() в пакете party / partykit для построения дерева выживания модели выживания.
Общая выживаемость хорошая, в худшем случае 95% выживания, поэтому я хотел бы изменить yscale на c(0.9, 1) , чтобы панели были полезны на...
130 просмотров
schedule
27.03.2024
Как добавить стрелки на участок леса в survminer (ggforest)
Мне было интересно, есть ли способ добавить две стрелки к оси x лесного участка, аналогично тому, что показано в этом примере: Как добавить стрелки на лесной участок? (этот код не работает на ggforest)
Вот пример кода:
library(survival)...
1696 просмотров
schedule
22.03.2023
Кто-нибудь знает, в чем разница между n и strata в сурвообъекте?
Всякий раз, когда я использую survfit в R, я получаю разные значения для n и слоев: например, я получаю n: 150, 167 (добавьте 317, что является общим вводом) слои: 149, 163
На странице справки ?survival::survfit.object :
n = общее...
56 просмотров
schedule
27.04.2023
Почему у меня восходящая кривая выживания (кумулятивная заболеваемость)?
Я не знаю как, но кривая выживания, которая должна идти вниз, выходит вверх. На самом деле я получаю кумулятивную кривую заболеваемости. Есть идеи, как найти и устранить проблему? Благодарю вас!
кривая выживания "вверх"
Кусок ДФ:...
32 просмотров
schedule
16.10.2022
Выполнение попарного теста и теста на тренд выживания
Я пытаюсь провести попарные тесты, чтобы определить, есть ли разница в выживаемости между парами групп.
используемые данные:
time_Untreated<- c(20, 21, 23, 24, 24, 26, 26, 27, 28, 30)
censor_Untreated<- c(rep(1,10), rep(0,0))...
427 просмотров
schedule
17.10.2022
Вопрос по установке пакета (анализ выживания)
Я столкнулся с этой проблемой, когда устанавливал пакет «survminer». Другие пакеты по-прежнему доступны для установки, кроме этого. Как я могу решить эту проблему? Должен ли я обновить Rstudio?
50 просмотров
schedule
29.06.2023
Как узнать, подвергаются ли данные цензуре в анализе выживания с использованием r
У меня есть набор данных, который выглядит так (бессмысленный пример):
id <- c(1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3)
year <- c(1990, 1991, 1992, 1989, 1990, 1991, 1992, 1993, 1989, 1990, 1992, 1993)
event<- c(0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,...
57 просмотров
schedule
03.08.2022
В регрессии Кокса категориальные уровни не показаны в моем выводе
В моих данных Hemoglobin_group — это категориальная переменная с 6 уровнями. Когда я запускаю приведенный ниже код, я не вижу Hemoglobin_group уровней в выводе. Как я могу решить эту проблему?
fit <-...
56 просмотров
schedule
04.01.2023
Принимает ли офицерский пакет объект ggsurvplot?
Я безуспешно пытаюсь экспортировать объект ggsurvplot в PowerPoint с помощью пакета Officer. Мне удалось найти множество инструкций о том, как использовать для этого уже полный ReporterS-пакет, и несколько упоминаний о том, что офицер тоже должен...
132 просмотров
schedule
11.06.2022
нанести на карту определенные группы внутри слоев в ggsurvplot
Интересно, как я могу отобразить только определенные группы в заранее определенных слоях. Например, в приведенных ниже примерах, как я могу, например, построить только sex:0,rx:Obs против sex:1,rx:Obs как один конкретный график выживания (не...
76 просмотров
schedule
05.03.2023
