Вопросы по теме 'pytables'

Проблемы с запуском встроенных PyTables на Mac
Я построил numpy 1.5.1, numexpr 1.4.2 и PyTables 2.2.1 на Mac и получаю следующую ошибку. Я погуглил, но нашел только одно место, где кто-то упоминает эту конкретную ошибку, и не нашел решения. Кто-нибудь знает что это значит? Спасибо, Дэйв...
1061 просмотров
schedule 27.07.2023

Проблема для вставки с использованием psycopg
Я читаю данные из файла .mat с помощью модуля Pytables. После прочтения данных я хочу вставить эти данные в базу данных с помощью psycopg. Вот пример кода: file = tables.openFile(matFile) x = 0 #populate the matData list for var in dest: data...
1363 просмотров
schedule 19.07.2022

Использование pytables, что более эффективно: scipy.sparse или плотная матрица numpy?
При использовании pytables нет поддержки (насколько я могу судить) для форматов матриц scipy.sparse , поэтому для хранения матрицы мне нужно выполнить некоторое преобразование, например. def store_sparse_matrix(self): grp1 =...
2102 просмотров
schedule 12.07.2023

Pytables - удалить строки из таблицы по некоторым критериям
У меня есть одна таблица со столбцом Time32 и большим количеством строк. Моя проблема следующая. Когда моя таблица достигает тысячи миллионов строк, я хочу начать архивировать каждую строку старше указанного значения. Для создания запроса я буду...
1055 просмотров
schedule 05.08.2022

Как заставить Pypy распознавать сторонние модули
Просто быстрый вопрос: как мне заставить pypy распознавать сторонние модули, которые у меня есть в Python? Например, я получаю следующую ошибку. from tables import * ImportError: No Module named tables Что в основном говорит о том, что он не...
14042 просмотров
schedule 16.10.2022

Предупреждения Pandas Pytables и низкая производительность
Я тестировал pandas и pytables для некоторых больших наборов финансовых данных и столкнулся с настоящим камнем преткновения: При сохранении в файле pytables панды, по-видимому, хранят многомерные данные в очень длинных строках, а не в столбцах....
2442 просмотров
schedule 04.11.2022

Неподдерживаемая версия HDF5
Пытаюсь установить Pytables, и я установил почти все зависимости: Однако, когда я пытаюсь установить pytables: * Found numpy 1.7.0b1 package installed. * Found numexpr 2.0.1 package installed. * Found Cython 0.16 package installed. * Found HDF5...
514 просмотров
schedule 09.07.2022

Дополнительные записи появляются в таблице pytable при создании/добавлении из numpy zero recarray
(этот вопрос был изменен первоначальным автором, а пример кода изменен, чтобы вы могли запустить его на своем компьютере) Я загружаю данные временных рядов в pytables (~ 2 миллиона строк, 23 столбца в основном с плавающей запятой в этом тестовом...
253 просмотров
schedule 13.09.2023

вложенные pytables
Предположим, вы передаете словарь конструктору pytable: h5f.createTable('/','table',{'col1':Float64Col(pos=0),'col2':StringCol(16,pos=1)}) У меня есть следующие три вопроса новичка, связанные с вложенными таблицами pytables: 1) Как вы...
297 просмотров
schedule 12.06.2023

Python: могу ли я установить глобальные переменные в модуле пакета __init__?
Итак, я читаю ответ Алекса Мартелли на другой вопрос ... «Один пример, в котором мне может понадобиться инициализация, — это когда во время загрузки пакета я хочу раз и навсегда прочитать кучу данных (скажем, из файлов, БД или Интернета) — в...
8299 просмотров

Проблемы с тем, чтобы HDF5 работал с pyTables
Я бился головой о стену, пытаясь настроить pyTables на OSX 10.8. Я использую дистрибутив Python Enthought, установил pyTables и numexpr с PIP и использовал Homebrew для установки пакета HDF5. Однако, когда я пытаюсь импортировать таблицы в python,...
789 просмотров
schedule 20.03.2023

Эффективно хранить большую разреженную матрицу (с плавающей запятой)
Я ищу решение для хранения около 10 миллионов чисел с плавающей запятой (двойной точности) разреженной матрицы. Матрица на самом деле представляет собой двумерную треугольную матрицу, состоящую из 1 миллиона на 1 миллион элементов. Элемент (i,j)...
1636 просмотров
schedule 21.10.2023

PyTables, работающие с данными, размер которых во много раз превышает размер памяти.
Я пытаюсь понять, как PyTables управляет данными, размер которых больше размера памяти. Вот комментарий в коде PyTables ( ссылка на GitHub ): # Nodes referenced by a variable are kept in `_aliveNodes`. # When they are no longer referenced, they...
2162 просмотров
schedule 02.07.2023

Поиск PyTables в ядре на Time64Col
Я использую PyTables 2.4.0 и Python 2.7. У меня есть база данных, содержащая следующую типичную таблицу: /anc/asc_wind_speed (Table(87591,), shuffle, blosc(3)) 'Wind speed' description := { "value_seconds": Time64Col(shape=(), dflt=0.0,...
387 просмотров
schedule 10.03.2023

Порядок вложенных структур в таблице PyTable
Предположим, у меня есть следующий дескриптор столбца PyTable: import numpy as np import tables as pt class Date_t(pt.IsDescription): year = pt.Int32Col(shape=(), dflt=2013, pos=0) month = pt.Int32Col(shape=(), dflt=1, pos=1)...
138 просмотров
schedule 31.07.2023

PyTables, Создание таблицы без открытия файла hdf5
Можно ли создать таблицу PyTables, не открывая и не создавая файл hdf5? Что я имею в виду и что мне нужно, так это создать таблицу (ну на самом деле очень много таблиц) в разных процессах, работать с этими таблицами и сохранять таблицы в файл hdf5...
725 просмотров
schedule 04.07.2022

В чем преимущество PyTables?
Недавно я начал изучать PyTables и нашел это очень интересным. Мой вопрос: Каковы основные преимущества PyTables по сравнению с базами данных, когда речь идет об огромных наборах данных? Какова основная цель этого пакета (я могу сделать такое...
3761 просмотров
schedule 26.12.2022

Обновить pandas DataFrame, хранящийся в Pytable, с другим pandas DataFrame
Я пытаюсь создать функцию, которая обновляет сохраненный DataFrame pandas, который я сохранил в PyTable, новыми данными из DataFrame pandas. Я хочу проверить, отсутствуют ли некоторые данные в PyTable для определенных DatetimeIndexes (значение NaN...
2563 просмотров
schedule 17.11.2023

ptrepack sortby нужен «полный» индекс
Я пытаюсь ptrepack файл HDF, созданный с помощью интерфейса pytables pandas HDFStore. Основным индексом фрейма данных было время, но я сделал еще несколько столбцов data_columns , чтобы я мог фильтровать данные на диске через эти столбцы данных....
4221 просмотров
schedule 11.07.2022

Не удается открыть файлы Matlab с использованием последней версии HDF5
Недавно я обновил таблицы в своей установке Python, и, похоже, с библиотеками HDF5 происходят некоторые странные вещи. У меня есть куча данных, которые изначально были сохранены в виде файла .mat, в котором используется формат HDF5. Я читал это в...
753 просмотров
schedule 26.05.2024