Вопросы по теме 'nlme'

Изменение порядка панелей в решетчатых графиках в nlme
Я хотел бы опубликовать цифру augPred, созданную nlme, поэтому она должна выглядеть немного лучше (говорят рецензенты). Я хочу переупорядочить панели и изменить заголовки. Я пробовал использовать информацию, которую нашел для решетки, но почему-то...
1159 просмотров
r lattice nlme
schedule 03.02.2022
nlme fit: vcov и сводка
Я установил модель, используя nlme() из package nlme . Теперь я хочу смоделировать некоторые интервалы прогнозирования с учетом неопределенности параметров. Для этого мне нужно извлечь матрицу дисперсии для фиксированных эффектов....
748 просмотров
r nlme
schedule 22.08.2022
Получите чистую сводку nlme.lme() или lme4.lmer() в RPy
Я взаимодействую с функциями nlme и lme4 R через RPy, и я хотел бы получить доступ к сводке вывода из моей консоли Python. Я запускаю следующий код: test1=nlme.lme(r.formula('Pupil~CoI*Time'), random=r.formula('~1|ID'),data=dfr)...
1402 просмотров
python r rpy2 lme4 nlme
schedule 08.06.2024
Ошибка «несогласованные массивы» во взвешенной нелинейной смешанной модели
Я успешно подогнал нелинейную смешанную модель с помощью функции nlme() пакета nlme, но при попытке улучшить указанную модель, включив аргумент весов, я получаю только ошибки, которые не могу интерпретировать, и поэтому не могу точно определить...
1987 просмотров
r mixed-models weighted nlme nonlinear-functions
schedule 25.11.2022
Извлечь случайную формулу из объектов nlme
Я пытаюсь извлечь случайную структуру из моделей, построенных с использованием lme , но, похоже, я не могу получить ничего, кроме фиксированной формулы. Например., library(nlme) fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)...
408 просмотров
r lme4 mixed-models nlme
schedule 22.03.2022
Как прогнозировать с помощью nlme::predict.lme, не вызывая весь «объект»
Используя функцию lme , я подогнал модель к большому набору данных с почти 470 тысячами наблюдений и примерно 40 переменными. Размер этой подгонки ( object.size(fit) ) составляет около 300 МБ, что невозможно хранить на сервере. Цель состоит в том,...
1053 просмотров
r nlme
schedule 02.06.2023
Создать объект lme внутри функции
Фон Я пытаюсь подогнать смешанную модель к функции, основанной на некоторых параметрах. Если я хочу использовать contrast из library(contrast) , я должен использовать обходной путь, так как contrast использует слот call из объекта lme...
606 просмотров
r lm nlme
schedule 25.05.2023
Построение индивидуальных доверительных интервалов для коэффициентов в lmList fit
Я пытаюсь решить упражнение из книги Пинейро и Бейтса (Модели со смешанными эффектами в S и S-PLUS), используя R. Он использует пиксель данных из пакета nlme. В упражнении говорится: используйте lmList, чтобы подобрать отдельную квадратичную модель...
785 просмотров
r plot confidence-interval nlme quadratic
schedule 13.03.2023
Ошибка в pars[, нм]: неправильное количество измерений
Я новичок в кодировании, а также в размещении сообщений на форуме, но я сделаю все возможное, чтобы объяснить проблему и дать достаточно информации, чтобы вы могли помочь мне решить ее. Я много искал решения для подобных ошибок, но весь код, который...
209 просмотров
r nlme
schedule 25.02.2024
извлечь компоненты дисперсии из lme
У меня есть измерения данного признака (TRAIT1) у особей разных генотипов, выращенных либо при температуре1, либо при температуре2. Я хочу проверить влияние генотипа (случайный эффект) и температуры (температура пересекается с генотипом) на мой...
2450 просмотров
r variance nlme
schedule 18.10.2022
Построение списка нелинейных регрессий с помощью ggplot
В качестве выходного графика нелинейного регрессионного анализа по этой ссылке https://stats.stackexchange.com/questions/209087/non-linear-regression-mixed-model С этим набором данных: zz <-(" iso temp diam Itiquira 22 5.0 Itiquira...
1430 просмотров
r list ggplot2 nlme
schedule 06.04.2022
ковариационная структура для многоуровневого моделирования
У меня есть многоуровневый набор данных повторных измерений около 300 пациентов, у каждого из которых до 10 повторных измерений предсказывают рост тропонина. В наборе данных есть и другие переменные, но я не включил их сюда. Я пытаюсь использовать...
439 просмотров
r multi-level covariance nlme
schedule 21.07.2023
Формула модели NLME GLS
У меня есть сценарий, который с учетом переменной ответа и предикторов генерирует все возможные комбинации моделей. Я сохранил все комбинации для своих данных в списке (длина 155). Я написал цикл, который на каждой итерации использует следующую...
51 просмотров
r nlme
schedule 17.05.2023
Задание нелинейной связи между случайными эффектами в R
Я работаю с многоуровневыми моделями, пытаясь описать различные закономерности лонгитюдных изменений. Dingemanse et al (2010) описывают схему "разветвления", когда случайный эффекты полностью коррелированы. Однако я обнаружил, что аналогичная...
503 просмотров
r multi-level mixed-models nlme r2jags
schedule 28.06.2022
Пакет Lsmeans в R - степени свободы с моделями lme
У меня вопрос относительно степеней свободы, используемых пакетом lsmeans в случае линейной смешанной модели, построенной с помощью пакета nlme. Вот пример, иллюстрирующий мой вопрос на основе набора данных Oats. Я не пытаюсь обсуждать, актуальна...
2065 просмотров
r nlme lsmeans
schedule 08.12.2023
Визуализируйте многоуровневую модель роста с помощью nlme/ggplot2 и lme4/ggplot2
Я безуспешно пытаюсь визуализировать результаты объекта nlme . Когда я делаю это с объектом lmer , создается правильный график. Моя цель — использовать nlme и визуализировать подогнанную кривую роста для каждого человека с помощью ggplot2 ....
1256 просмотров
r ggplot2 nlme
schedule 20.07.2022
R: как извлечь информацию из сводной модели соответствия
library(nlme) fm1 <- nlme(height ~ SSasymp(age, Asym, R0, lrc), data = Loblolly, fixed = Asym + R0 + lrc ~ 1, random = Asym ~ 1, start = c(Asym = 103, R0 = -8.5, lrc = -3.3)) > summary(fm1)...
2021 просмотров
r nlme
schedule 21.04.2022
R: извлечение информации из подробного вывода в nlme fit
library(nlme) fm2 <- nlme(height ~ SSasymp(age, Asym, R0, lrc), data = Loblolly, fixed = Asym + R0 + lrc ~ 1, random = Asym ~ 1, start = c(Asym = 103, R0 = -10, lrc = -8), verbose = TRUE)...
202 просмотров
r output mixed-models nlme
schedule 22.04.2022
Извлечение входных и выходных переменных из nlme приводит к R
Я пытаюсь автоматизировать графики (подгонка входной переменной по сравнению с моделью, подгонка по сравнению с выходной переменной модели) из моделей и хотел бы изолировать имена входных и выходных переменных от результатов nlme(). Я справился с...
92 просмотров
r variables extract nlme
schedule 11.01.2024
Можно ли использовать ковариационную матрицу для задания корреляционной структуры в функции nlme gls?
Я хочу использовать функцию gls в пакете R nlme для анализа набора вложенных пространственных выборок, в которых многие выборки перекрываются по крайней мере в некоторых пространственных координатах. Я хочу учитывать независимость в переменной ответа...
1026 просмотров
r regression nlme
schedule 09.09.2022