Вопросы по теме 'mixed-models'
Добавление abline к графику augPred
извините за то, что, вероятно, будет очень простым вопросом, я очень новичок в R.
Я хочу прочитать свой график augPred, чтобы усреднить значения, чтобы обеспечить прогноз между периодом времени.
> head(tthm.groupeddata)
Grouped Data: TTHM ~...
324 просмотров
schedule
14.10.2022
Указание корреляционной структуры для линейной смешанной модели с использованием пакета рамп в R
Я пытаюсь создать линейную смешанную модель (lmm), которая допускает пространственную корреляцию между точками (имеет широту/долготу для каждой точки). Я хотел бы, чтобы пространственная корреляция основывалась на большом круговом расстоянии между...
6237 просмотров
schedule
27.04.2023
Получение R в квадрате из многоуровневой модели со смешанными эффектами в metafor
Я провожу мета-анализ в R конкретной обработки лесов. Для этой модели мне нужно подогнать случайные эффекты, чтобы учесть различия в методах исследования и вариации возраста участков, поскольку оба эти фактора являются смешивающими переменными, и я...
3157 просмотров
schedule
14.07.2022
предупреждающие сообщения с использованием функции glmer из пакета lme4 R
Я пытаюсь подобрать логистическую модель случайного перехвата, используя функцию glmer из пакета lme4. К сожалению, я получаю следующие предупреждающие сообщения и явно неправильные результаты (для коэффициентов).
Warning messages:
1: In...
1710 просмотров
schedule
09.10.2022
Ошибка «несогласованные массивы» во взвешенной нелинейной смешанной модели
Я успешно подогнал нелинейную смешанную модель с помощью функции nlme() пакета nlme, но при попытке улучшить указанную модель, включив аргумент весов, я получаю только ошибки, которые не могу интерпретировать, и поэтому не могу точно определить...
1987 просмотров
schedule
25.11.2022
как интерпретировать p-значения на моделях со значимыми условиями взаимодействия на glmer?
Я проверяю различия в отложении пыльцы между двумя средами обитания (вторгшимися и не подвергшимися вторжению) и тремя разными типами стигмы (влажными, сухими и полусухими). Это подход сообщества с несбалансированным количеством образцов и видов на...
821 просмотров
schedule
18.09.2022
R: как оценить модель фиксированных эффектов с весами
Я хотел бы запустить модель фиксированных эффектов с использованием OLS с взвешенными данными.
Поскольку здесь может возникнуть некоторая путаница, я хочу сказать, что я использовал здесь «фиксированные эффекты» в том смысле, который обычно...
1616 просмотров
schedule
05.05.2023
ошибка Ошибка: шаговой коэффициент уменьшен ниже 0,001 без снижения pwrss при использовании nlmer
Я думаю, что это может быть больше вопрос статистики, чем вопрос R, но у меня есть ошибка Error: step factor reduced below 0.001 without reducing pwrss при попытке подогнать функцию nlmer к данным. Мои данные:...
2810 просмотров
schedule
17.10.2022
Извлечь случайную формулу из объектов nlme
Я пытаюсь извлечь случайную структуру из моделей, построенных с использованием lme , но, похоже, я не могу получить ничего, кроме фиксированной формулы. Например.,
library(nlme)
fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)...
408 просмотров
schedule
22.03.2022
Ошибка LME: ошибка в reStruct
4 улья были оснащены датчиками, которые регистрировали температуру, влажность, давление, децибелы внутри улья. это переменные ответа.
лечение представляло собой воздействие Wi-Fi, экспериментальные группы подвергались воздействию Wi-Fi с 1-го по...
2057 просмотров
schedule
23.06.2022
Вычисление R в квадрате для пуассоновской GLMM с использованием MuMIn r.squaredGLMM
Я моделирую численность вида птиц, используя обобщенную смешанную модель Пуассона, используя glmer в пакете R "lme4". Пример моих данных:
abund point_id patch_area vis_per_year year
6 EL_03Plot035 244.69412 C_5 2003
0...
3181 просмотров
schedule
29.01.2023
Случайный эффект glm в сообщении об ошибке glmer
Это подмножество набора данных, в котором я пытаюсь запустить glm, учитывая случайный эффект некоторых операторов, выполняющих более одного измерения:...
416 просмотров
schedule
22.06.2022
Как создать макрос в SAS для повторения PROC MIXED в большом наборе данных
В настоящее время я работаю с набором данных из 760 метаболитов. Эти метаболиты были предоставлены 15 видам бактерий. Кроме того, их рост отслеживали при двух оптических плотностях (OD) в трех повторностях. Таким образом, у меня есть набор данных...
603 просмотров
schedule
28.02.2022
Справка glmmadmb: множественные ошибки при запуске моделей
Я пытаюсь запустить модель смешанных эффектов, которая включает три фиксированных эффекта с взаимодействием и случайным пересечением и наклоном. Модель, которую я пытаюсь указать в glmmadmb:
>...
756 просмотров
schedule
19.03.2023
lsmeans и difflsmeans не возвращают вывода для объекта lmer
Я пытаюсь рассчитать доверительные интервалы для фиксированных эффектов в смешанной модели lmer, а difflsmeans и lsmeans просто возвращают пустую таблицу. Я пробовал lme (), но у меня проблемы с конвергенцией модели (следовательно, использую lmer)....
1338 просмотров
schedule
21.02.2022
Включение временных рядов в модель смешанных эффектов в R (с использованием lme4)
Я искал похожие вопросы, и у меня не получилось, поэтому извиняюсь, если есть связанные вопросы, которые я пропустил.
Я смотрю на количество времени, потраченное на кормушки (зависимая переменная) в различных условиях, когда каждый субъект посещает...
8874 просмотров
schedule
25.12.2022
R - смешанный дисперсионный анализ 2x2 с простым анализом эффекта повторных измерений
Я хотел бы спросить, как правильно выполнить простой анализ главного эффекта в R в случае наличия эффектов взаимодействия между переменными Group и Stage?
Один из моих друзей делает такой же анализ в SPSS (с поправкой Бонферрони), и я пытаюсь...
1102 просмотров
schedule
04.06.2022
lmer Получить значения p от anova
lmerTest был разработан как оболочка, позволяющая оценить p-values из анализа смешанной модели Лмера с использованием оценки Саттертуэйта степеней свободы знаменателя (ddf). Но lmerTest теперь кажется сломанным. В настоящее время он возвращает...
2361 просмотров
schedule
27.03.2022
ошибки mgcv::gamm() и MuMIn::dredge()
Я пытался подогнать несколько GAM с помощью пакета mgcv внутри функции и грубо выбрать наиболее подходящую модель с помощью процедур выбора модели. Но моя функция запускает первую модель, а затем, похоже, снова не распознает входные данные dat ....
652 просмотров
schedule
08.10.2022
Предупреждение GLMER: матрица дисперсии-ковариации [] не является положительно определенной или содержит значения NA
Иногда я обнаруживаю, что мои GLMM из glmer , пакет lme4 , показывают следующие предупреждающие сообщения, когда вызывается их сводка:
Warning messages:
1: In vcov.merMod(object, use.hessian = use.hessian) :
variance-covariance matrix computed...
7343 просмотров
schedule
06.07.2022