Вопросы по теме 'lme4'
Построение результатов регрессии из lme4 в R с использованием решетки (или чего-то еще)
Я подогнал регрессию с помощью lme4 благодаря предыдущему ответу . Теперь, когда у меня есть регрессия, подходящая для каждого состояния, я хотел бы использовать решетку для построения графиков QQ для каждого состояния. Я также хотел бы построить...
4961 просмотров
schedule
14.01.2023
Предупреждающее сообщение в смешанной модели lme4
В чем смысл следующего предупреждающего сообщения при подборе модели glmer с использованием пакета lme4?
Warning messages:
1: glm.fit: fitted probabilities numerically 0 or 1 occurred
2: In mer_finalize(ans) : false convergence (8)
Модель,...
5131 просмотров
schedule
08.11.2022
Как добавить фиксированный эффект в четырехпараметрическую логистическую модель в nlmer
Я пытаюсь использовать nlmer с SSfpl , чтобы сопоставить некоторые данные с логистической функцией с четырьмя параметрами. Я могу получить точную подгонку для общих данных, используя:
nm.fpl <- nlmer(meanFix ~ SSfpl(Time, A, B, xmid, scal)...
1945 просмотров
schedule
04.07.2023
Получение вывода lmer в word/excel
Я работаю в R с пакетом под названием lme4 .
Выполнение модели:
lmer.rasch <- lmer(Response ~ item -1 + (1|STIDSTD),family=binomial, data=exampledata)
получает вывод в консоль, как показано в конце поста. Я хотел скопировать это,...
10809 просмотров
schedule
26.12.2022
Обновление lme4 выдает сообщение об ошибке Ошибка в `[[‹ -. data.frame` (`* tmp *`, i, value = integer (0))
На прошлой неделе я построил обобщенную смешанную линейную модель с lmer (lme4), которая отлично работала:
fit<-lmer(dat$presence~log(dat$SIZE_strict)*dat$Troph_level+log(dat$HAB500EXCL_strict+1)+(1|dat$dataset), family=poisson, REML=FALSE)...
3637 просмотров
schedule
10.04.2023
Как я могу запустить lme4 с pvals.fnc для вычисления значения p в Mavericks
Раньше все работало нормально, но теперь, после того как я обновил свой Macbook до Mavericks и R до 3.0.2, мне также нужно обновить пакеты languageR и lme4, теперь languageR — 1.4, а lme4 — 1.0.4.
Проблема в том, что я всегда получаю эту ошибку:...
1932 просмотров
schedule
11.03.2023
R: Начальная загрузка с многоуровневой моделью
Я хочу рассчитать 95% доверительные интервалы вокруг оценок коэффициентов моей многоуровневой модели.
У меня нет проблем с моделями с одной группирующей переменной, но метод начальной загрузки, которому я следовал (...
2623 просмотров
schedule
09.07.2023
Объяснение ошибки с lmer, но не с glmer: ошибка в checkNlevels(reTrms$flist, n = n, control):
У меня есть такая модель:
lmer(y ~ x + z + (1|g) + (1|dummy) , data = dat)
Где dummy — случайный эффект на отдельном уровне, учитывающий сверхдисперсию, т. е. factor(1:nrow(dat))
при запуске этого я получаю следующую ошибку, которую я...
1329 просмотров
schedule
25.02.2023
Получите чистую сводку nlme.lme() или lme4.lmer() в RPy
Я взаимодействую с функциями nlme и lme4 R через RPy, и я хотел бы получить доступ к сводке вывода из моей консоли Python.
Я запускаю следующий код:
test1=nlme.lme(r.formula('Pupil~CoI*Time'), random=r.formula('~1|ID'),data=dfr)...
1402 просмотров
schedule
08.06.2024
предупреждающие сообщения с использованием функции glmer из пакета lme4 R
Я пытаюсь подобрать логистическую модель случайного перехвата, используя функцию glmer из пакета lme4. К сожалению, я получаю следующие предупреждающие сообщения и явно неправильные результаты (для коэффициентов).
Warning messages:
1: In...
1710 просмотров
schedule
09.10.2022
Использование ggtittle внутри цикла для именования нескольких графиков
Итак, я строю серию моделей lmer, используя ggplot2 внутри цикла, однако у меня возникают проблемы с определением заголовков каждого графика внутри цикла.
Пример данных
dput(data)
structure(list(Reaction = c(249.56, 258.7047, 250.8006,...
91 просмотров
schedule
16.06.2023
Извлечь случайную формулу из объектов nlme
Я пытаюсь извлечь случайную структуру из моделей, построенных с использованием lme , но, похоже, я не могу получить ничего, кроме фиксированной формулы. Например.,
library(nlme)
fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)...
408 просмотров
schedule
22.03.2022
Предсказание.glmer на тренировочном наборе различается с новыми данными и без них.
Это может быть скорее отчет об ошибке, чем вопрос, но: почему явное использование аргумента newdata для прогнозирования с использованием того же набора данных, что и обучающие данные, иногда приводит к другим прогнозам, чем пропуск аргумента...
218 просмотров
schedule
24.01.2023
Точность классификации предсказаний биномиального glmer()
Я напряг свои (не сообразительные) мозги, пытаясь заставить R выдавать процент правильных прогнозов для биномиальной модели мерцания. Я знаю, что это не очень информативно статистически, но об этом часто сообщают; так что я хотел бы сообщить об...
2347 просмотров
schedule
23.02.2023
Вычисление R в квадрате для пуассоновской GLMM с использованием MuMIn r.squaredGLMM
Я моделирую численность вида птиц, используя обобщенную смешанную модель Пуассона, используя glmer в пакете R "lme4". Пример моих данных:
abund point_id patch_area vis_per_year year
6 EL_03Plot035 244.69412 C_5 2003
0...
3181 просмотров
schedule
29.01.2023
Как предсказать условия объектов merMod (lme4)?
Для простых объектов glm я могу использовать predict(fit, type = "terms") для получения матрицы с подогнанными значениями для каждого термина.
Что эквивалентно lmer соотв. glmer подогнанные модели? Насколько я вижу, функция...
423 просмотров
schedule
17.01.2023
Извлечь необработанную матрицу модели случайных эффектов из объектов lmer (lme4, R)
У меня есть вопрос относительно извлечения (необработанной) модельной матрицы случайных эффектов из моделей, оснащенных lmer ( lme4 ) в R. В частности, я хочу получить фрейм данных или матрицу, содержащую все переменные, которые участвуют в...
1439 просмотров
schedule
11.05.2023
объект не найден в функции: nlmer edition
За последние несколько часов я нашел здесь несколько вопросов относительно сценария R, который отлично работает вне функции, но возвращает ошибку «объект не найден» для аргумента после того, как код реорганизован для включения функций. К сожалению,...
656 просмотров
schedule
01.11.2022
Создание прогнозного моделирования на основе многоуровневой модели со случайными перехватами
Я изо всех сил пытаюсь понять, как в R создавать прогнозные симуляции для новых данных с использованием многоуровневой модели линейной регрессии с одним набором случайных перехватов. Следуя примеру этого текста на стр. 146-147, я могу выполнить это...
999 просмотров
schedule
16.08.2023
решение предупреждающего сообщения с помощью glmer
Как и у многих других, у меня проблемы с запуском модели, использующей функцию glmer из пакета lme4.
Вот моя модель:
model = glmer(depvar ~ variety*cover+amplitude+time+ (1|pp) + (1|stim),
data = datafile, family=poisson)
И вот...
15965 просмотров
schedule
26.11.2022
