Вопросы по теме 'iranges'
Перекрытие между двойными диапазонами по сравнению с выборкой двойных диапазонов
Я нашел другие сообщения об общем поиске перекрывающихся диапазонов в R iRanges, но не могли бы вы помочь мне с этим дополнительным небольшим поворотом: у меня есть два диапазона, которые связаны (возможная геномная перестройка с начальным диапазоном...
66 просмотров
schedule
03.07.2023
Диаграмма Венна из GRanges
У меня есть такие объекты, как эти (показаны два из четырех):
> upmd_Hf3a
GRanges object with 398117 ranges and 2 metadata columns:
seqnames ranges strand | type nCG
<Rle>...
1142 просмотров
schedule
21.08.2022
Эффективно построить GRange/IRanges из вектора Rle
У меня есть закодированный вектор длины прогона, представляющий некоторое значение в каждой позиции генома по порядку. В качестве игрушечного примера предположим, что у меня есть только одна хромосома длиной 10, тогда у меня будет вектор, похожий на...
438 просмотров
schedule
26.04.2022