Публикации по теме 'h5py'
Использование файлов .mat в Python
Ученые-исследователи и ученые часто используют MatLab и Octave в области связи и для обработки космических изображений, анализа ДНК, обработки изображений для обнаружения рака и опухолей.
MatLab или Octave удобны для ученых, чтобы легко работать с изображениями, а форма кодирования удобна для них, чтобы они могли легко использовать математические навыки без особых знаний в области программирования.
В MatLab или Octave мы сохраняем файлы с расширением .mat. Разрыв между исследованиями и..
Вопросы по теме 'h5py'
Составные типы данных с h5py: тип данных внутри атрибута
Я использую Silo с HDF5, и у меня возникают проблемы с доступом к некоторым метаданные с помощью h5py. Он выдает довольно необычную структуру HDF5, где он помещает DATATYPE внутри DATATYPE . Вот выдержка из вывода h5dump :
DATATYPE...
2198 просмотров
schedule
10.03.2023
hdf5/h5py ImportError: libhdf5.so.7
Я работаю над проектом, связанным с очередями обмена сетевыми сообщениями (msgpack, zmq,...) в системе RHEL 6.3 (x86_64). Я устанавливал самые последние пакеты glib, gevent, pygobject, pygtk и т. д., чтобы заставить работать pylab/matplotlib (что...
11097 просмотров
schedule
02.01.2023
Как сохранить словарь в наборе данных HDF5
У меня есть словарь, где ключ — объект datetime, а значение — кортеж целых чисел:
>>> d.items()[0]
(datetime.datetime(2012, 4, 5, 23, 30), (14, 1014, 6, 3, 0))
Я хочу сохранить его в наборе данных HDF5, но если я попытаюсь просто...
43276 просмотров
schedule
29.03.2023
Объединение файлов hdf5
У меня есть несколько файлов hdf5, каждый из которых имеет один набор данных. Наборы данных слишком велики для хранения в ОЗУ. Я хотел бы объединить эти файлы в один файл, содержащий все наборы данных по отдельности (т.е. не для объединения...
28709 просмотров
schedule
18.02.2022
Проблема производительности с циклом в наборах данных с h5py
Я хочу применить простую функцию к наборам данных, содержащимся в файле hdf5. Я использую код, подобный этому
import h5py
data_sums = []
with h5py.File(input_file, "r") as f:
for (name, data) in f["group"].iteritems():
print name...
1679 просмотров
schedule
02.01.2024
numpy, h5py: как мне сделать массив, отсортированный по одному из его столбцов, из большего массива, сохраненного с помощью h5py?
Я хотел бы дать вам некоторую справочную информацию, чтобы вы лучше поняли мою проблему.
По результатам эксперимента я заполняю большую таблицу hdf5 с большим количеством столбцов, используя h5py. После того, как все мои измерения сделаны, мне...
1178 просмотров
schedule
28.06.2023
Как читать массив Matlab в Python с помощью h5py
у меня есть массив Matlab> 2 ГБ ... я хочу прочитать его с помощью h5py. Данные представляют собой простой трехмерный двойной массив. Но я просто не мог найти подсказку в Интернете.
Кто-нибудь может мне помочь ? Мне просто нужен пример, как это...
19333 просмотров
schedule
02.09.2023
Как перезаписать массив внутри файла h5 с помощью h5py
Я пытаюсь перезаписать массив numpy, который является небольшой частью довольно сложного файла h5.
Я извлекаю массив, меняю некоторые значения, а затем хочу повторно вставить массив в файл h5.
У меня нет проблем с извлечением вложенного массива....
33293 просмотров
schedule
04.06.2023
h5py порядок набора данных по имени набора данных
Я создаю файлы h5 с 5 наборами данных ['a160'], ['a1214']
Как я могу сделать так, чтобы наборы данных сортировались по имени набора данных..
Например, когда я делаю h5dump в своем файле, я получаю:
HDF5 "jjjj.h5" {
GROUP "/" {
DATASET...
1079 просмотров
schedule
05.01.2024
Поиск значения атрибута в базе данных HDF5 с помощью H5PY
Я использую Python для хранения данных в базе данных HDF5.
Каждый набор данных имеет список связанных с ним атрибутов.
Я хотел бы получить все наборы данных, которые имеют заданное значение атрибута.
Например, один атрибут temperature может...
4755 просмотров
schedule
31.05.2024
Как частично скопировать с помощью python файл Hdf5 в новый с той же структурой?
У меня есть большой файл hdf5, который выглядит примерно так:
A/B/dataset1, dataset2
A/C/dataset1, dataset2
A/D/dataset1, dataset2
A/E/dataset1, dataset2
...
Я хочу создать новый файл только с этим: A / B / dataset1, dataset2, A / C /...
14079 просмотров
schedule
19.05.2022
Средство просмотра HDF5 для сжатых массивов LZF
Я использую h5py со сжатием LZF для хранения NumPy массивы в файлах HDF5.
Это работает хорошо, и мои сжатые файлы гораздо более переносимы, чем несжатые. Однако если я попытаюсь просмотреть сжатые файлы с помощью таких приложений, как vitables...
1422 просмотров
schedule
12.12.2022
IOError: не удается прочитать данные (не удается открыть каталог) — отсутствует фильтр сжатия gzip
Я никогда раньше не работал с файлами HDF5, и для начала я получил несколько примеров файлов. Я проверил все основы работы с h5py , просматривая различные группы в этих файлах, их имена, ключи, значения и так далее. Все работает нормально, пока я...
4303 просмотров
schedule
06.01.2023
Как разделить память из набора данных HDF5 с NumPy ndarray
Я пишу приложение для потоковой передачи данных с датчика, а затем обрабатываю данные различными способами. Эти компоненты обработки включают в себя визуализацию данных, некоторую обработку чисел (линейную алгебру), а также запись данных на диск в...
1216 просмотров
schedule
17.08.2022
Как импортировать файл .mat -v7.3 в python, используя h5py, НО с тем же порядком измерения?
У меня есть несколько файлов .mat, и каждый из них включает матрицу. Мне нужно импортировать их в python с помощью h5py, потому что они были сохранены с помощью -v7.3. Например:
*myfile.mat includes matrix X with the size of (10, 20)*
Я...
1155 просмотров
schedule
11.12.2023
Как загрузить с диска, обработать, а затем сохранить данные в общем hdf5 одновременно с python, pyqt, h5py?
Помещение:
Я создал главное окно. В одном из раскрывающихся меню есть пункт «ProcessData». Когда он выбран, я создаю QProgressDialog. Затем я много обрабатываю в основном цикле и периодически обновляю метку и процент в QProgressDialog.
Моя...
491 просмотров
schedule
30.09.2022
Добавить растровое изображение в файл HDF5 с помощью h5py
Прошу прощения, если это вопрос новичка, но я новичок в Python и HDF5. Я использую h5py, numpy и Python 2.7. У меня есть данные из разных файлов, которые нужно импортировать в один файл HDF5. Данные из каждого файла должны храниться в отдельной...
5312 просмотров
schedule
16.02.2024
Чтение ВСЕХ переменных в файле .mat с помощью python h5py
Я пытаюсь извлечь все переменные из файла '.mat' v7.3 и превратить их в массивы NumPy. Есть ли способ сделать это в общем, желательно без указания имен переменных? Как вы можете получить все существующие имена переменных из файла h5py.File, а затем...
10042 просмотров
schedule
26.11.2022
Распечатайте данные, содержащиеся в файле hdf (либо в файл, либо в виде диаграммы)
Если мне дан файл *.hdf, как я могу распечатать все содержащиеся в нем данные?
>>> import h5py
>>> f = h5py.File('my_file.hdf', 'r')
>>> # What's next?
Все вопросы здесь описывают, как либо создать файл hdf, либо...
1165 просмотров
schedule
12.08.2022
Как я могу обновить двухмерный массив с помощью h5py?
Я хочу сохранить двумерный массив с помощью hdf5 и не могу его обновить.
import numpy as np
import h5py
# create a new storage
fh = h5py.File('dummy.h5', 'w')
fh.create_dataset('random', data=np.array([[0, 1], [2, 3]]))
fh.close()
# try to...
141 просмотров
schedule
07.07.2023
