Я использую Heatmap.2 из gplots, чтобы сделать тепловую карту: library(gplots) # some fake data m = matrix(c(0,1,2,3), nrow=2, ncol=2) # make heatmap hm = heatmap.2(m) Когда я делаю 'heatmap.2' напрямую, я получаю график, который могу вывести...

У меня есть следующий код, который выполняет иерархическую кластеризацию и отображает их на тепловой карте. set.seed(538) # generate data y <- matrix(rnorm(50), 10, 5, dimnames=list(paste("g", 1:10, sep=""), paste("t", 1:5, sep=""))) # the...

Я пытаюсь создать тепловую карту с помощью пакета heatmap.2 . В моих данных много значений NaN , и я хотел бы сделать следующее. Каждый раз, когда есть значение NaN , просто сделайте ячейку окрашенной в светло-серый (или какой-либо другой...

Я новичок в R и столкнулся с проблемами с настройкой значений данных на график, который я сделал с помощью ggplot2. Вот код, который я использую для создания сюжета. sample.data <- read.csv(file = file.choose()) sample.data1 <-...

Я хочу создать тепловую карту с помощью функции heatmap.2 из пакета gplots . Это минимальный пример. require(gplots) # create symmetric matrix x = matrix(rnorm(100), nrow=10) diag(x) <- 1 x[upper.tri(x)] <- t(x)[upper.tri(x)]...

Я создал тепловую карту, используя тепловую карту.2 пакета gplots: library(gplots) abc <-read.csv(file="abc.txt", header=T, sep="\t", dec=".") abcm<-as.matrix(abc) def <-read.csv(file="def.txt", header=T, sep="\t", dec=".")...

У меня есть файл CSV с 8 строками и 5 столбцами, который выглядит так: ,MUT,AB1,M86,MU0,MZ4 2pc0,9.3235,9.2234,8.5654,6.5688,6.0312 2hb4,7.4259,7.9193,7.0837,6.1959,9.6501 3ixo,9.1124,4.8244,9.2058,5.6194,4.8181...

В настоящее время я создаю тепловую карту для некоторых данных, где значения для каждого элемента (OTU) сильно различаются, поэтому я использую параметр scale="row" . Я предположил, что это будет использовать один и тот же цветовой градиент для...

В моем наборе данных comp=structure(list(MYCT = c(125L, 29L, 29L, 29L, 29L, 26L, 23L, 23L, 23L, 23L, 400L, 400L), MMIN = c(256L, 8000L, 8000L, 8000L, 8000L, 8000L, 16000L, 16000L, 16000L, 32000L, 1000L, 512L), MMAX = c(6000L, 32000L, 32000L,...

Мне нужно сделать тепловую карту только с одним столбцом данных, я получаю сообщение об ошибке, в котором говорится, что «x» должен иметь как минимум 2 строки и 2 столбца». Как я могу создать тепловую карту в R только с одним столбцом данных?...

У меня есть файл, который выглядит так: Taxa,D0,D1,... 1,0,10,... 20,0,0,... ... Файл доступен здесь: https://www.dropbox.com/s/lvtxztz3kypnxre/Taxa_Conf.csv?dl=0 Когда я запускаю скрипт $CONCOCT/scripts/ConfPlot.R -c Taxa_Conf.csv...

Я создал диаграмму Венна с помощью пакета eulerr, но он не позволяет мне настраивать ее, и контуры внутренних кругов, кажется, касаются круга пространства образца. Я просмотрел руководство по пакету VennDiagram, но мне не повезло. Есть ли способ...

В настоящее время я пишу свою диссертацию, и у меня есть одна вещь, которую я не мог решить с помощью поиска в Интернете. У меня есть несколько наборов данных, и мне нужно сравнить результаты до и после, и я хотел бы визуализировать их, сравнив два...

Я использовал следующий код, чтобы создать тепловую карту для моего большого набора данных. Теперь я хочу получить название строк (название генов) для второго кластера (красный слева и зеленый справа). Сначала я попытался следовать инструкциям на...

и я пытаюсь создать двухслойный пирог, вот мои данные: winner <- c("White" , "draw" , "Black") lowrated_scotch1 <- c(0.56617647, 0.04411765, 0.38970588) #winrate for Whites,Draws,Blacks in chess...