Вопросы по теме 'cox-regression'

Регрессия Кокса в MATLAB
Я знаю, что в MATLAB есть функция COXPHFIT для выполнения Регрессия Кокса, но у меня проблемы с пониманием того, как ее применять. 1) Как сравнить две группы выборок с данными выживаемости в днях ( survdays ), цензурированием ( cens ) и...
2959 просмотров
r matlab survival-analysis cox-regression
schedule 30.09.2022
Могу ли я выполнить выбор всех переменных подмножеств для модели пропорциональных рисков Кокса в R?
Я пытаюсь использовать функцию, похожую, если не на самом деле, на regsubsets в пакете jumps в программе R при выборе лучших моделей Cox Proportional Hazards для моих данных. Это возможно? и если да, то функция уже существует?
3450 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 03.01.2024
Анализ выживания в нескольких состояниях с использованием пакета R Survival
Я пытаюсь оценить модель пропорциональных опасностей Кокса для перехода из состояния 1 в состояние 2 с использованием пакета R survival следующим образом: Altman <- coxph(Surv(Tstart, Tstop, to == 2) ~ wWCTA + wRETA + wEBITTA + wMETL +...
893 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 13.01.2023
Делаем прогнозы на основе модели коксфа
Мне трудно делать прогнозы с помощью coxph. Я хочу изучить модель Cox PH на данных в выборке, а затем использовать параметры, полученные из данных вне выборки, следующим образом: # learn IS params model.PH <- coxph(Surv(days.IS, outcome.IS)...
1654 просмотров
r predict cox-regression
schedule 01.11.2023
R время риска для каждой группы
Я подготовил анализ выживаемости и регрессию Кокса в R. Однако мой непосредственный руководитель является пользователем Stata и хочет, чтобы выходные данные отображались так же, как их отображает Stata, например. # Stata code . strate . stsum, by...
468 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 12.06.2022
Внешняя проверка модели Кокса с использованием rcorr.cens() и val.surv
У меня есть два независимых набора данных: один с 5421, а другой с 1000 субъектами. Что я хотел бы сделать, так это проверить модель Кокса, полученную из основного набора данных (main_dat, n = 5421), используя внешний набор данных (test_dat, n =...
1022 просмотров
r validation cross-validation cox-regression
schedule 21.07.2023
Ошибки сегментации в регрессии Кокса R с точными связями
Я пытаюсь подогнать большую дискретную модель пропорциональных опасностей (~ 100 тыс. строк, ~ 10 тыс. событий). Для этого я использовал coxph(..., method = "exact") , как рекомендовано в документации пакета выживания . документация, в которой...
371 просмотров
r cox-regression segmentation-fault stack-overflow
schedule 30.05.2022
Как я могу добавить p-значение к моему графику индекса соответствия в R?
В моей задаче анализа выживания я использовал пропорциональную модель Кокса для расчета значения индекса согласованности (c-индекс) в разных группах моего набора данных. Мне было интересно, как я могу добавить значение p к моему графику c-индекса,...
1233 просмотров
r bar-chart survival-analysis cox-regression p-value
schedule 27.06.2023
Прогнозировать вероятность по модели Кокса PH
Я пытаюсь использовать модель Кокса для прогнозирования вероятности отказа по прошествии определенного времени (что называется остановкой) 3. bladder1 <- bladder[bladder$enum < 5, ] coxmodel = coxph(Surv(stop, event) ~ (rx + size + number)...
14218 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 19.07.2022
Получите базовую функцию риска / функцию выживаемости из расширенной модели Кокса (с внешними зависящими от времени ковариатами)
Я применяю расширенную модель Кокса с внешними зависящими от времени ковариатами. Вот небольшой пример (df), который я позаимствовал и модифицировал из книги Темо и Грамбша Моделирование данных о выживании: расширение модели Кокса (2001): id...
3227 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 11.07.2023
Коэффициент риска регрессии Кокса в процентилях
Я вычислил регрессию пропорциональных рисков Кокса в R. cox.model <- coxph(Surv(time, dead) ~ A + B + C + X, data = df) Теперь у меня есть отношение рисков (HR или exp (coef)) для всех этих ковариат, но на самом деле меня интересуют только...
403 просмотров
r percentile cox-regression
schedule 12.07.2022
Отрицательная логарифмическая вероятность в теано (регрессия Кокса)
Я пытаюсь реализовать регрессию Кокса в theano. Я использую учебник по логистической регрессии ( http://deeplearning.net/tutorial/logreg.html ) в качестве основы и замены функции логистического логарифмического правдоподобия (LL) функцией LL...
745 просмотров
python machine-learning cox-regression theano
schedule 19.05.2023
Можно ли использовать кластерную функцию дважды в регрессии Кокса в R?
Итак, у меня есть запрос cox - поэтому я пытаюсь выполнить регрессию cox, и мне интересно, могу ли я сгруппировать данные дважды: cox1<-coxph(formula = Surv(time.to.arrive..trap, Arrived.1.or.0) ~ Is.feeder.control.or.stimulus...
227 просмотров
r cox-regression
schedule 18.07.2022
Модель пропорциональных рисков Кокса и модель Кокса, зависящая от времени в R
У меня есть данные о выживаемости , в которых описывается уровень смертности от трех типов услуги (салон, ресторан и экспресс) в течение десяти лет обучения. Данные содержат три переменные: тип обслуживания (1 = салон, 2 = ресторан и 3 =...
786 просмотров
r cox-regression
schedule 21.06.2022
Ковариа фактора нарушает предположение о пропорциональных рисках в модели coxph в R
Я возвращаюсь к теме, к которой обратился этот вопрос несколько месяцев назад. У меня есть модель Кокса, которая включает факторную ковариату (категориальную переменную) с тремя уровнями. Когда я тестирую модель на предмет нарушений...
740 просмотров
survival-analysis cox-regression
schedule 21.01.2023
Использование категорий в качестве новых переменных?
Я учу себя R с нескольких дней, и я застрял с регрессионным анализом Кокса. Мне удалось разделить каждую из имеющихся у меня непрерывных переменных на 2 категориальные группы с помощью функции cut() . Теперь мне интересно, могу ли я объединить...
94 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 07.08.2022
Пропорциональная опасность Кокса в JuMP.jl
Я впервые пробую JuMP.jl в Julia и не могу обойти ошибку. Вот моя установка. с использованием DataFrames, DataFramesMeta, JuMP, Ipopt #time to event times = [143,164,188,189,190,192,206,209,213,216,220,227,230,234,246,265,304,216,244,...
145 просмотров
julia cox-regression julia-jump
schedule 01.03.2023
Как смоделировать взаимодействие ковариаты со временем, когда предположение о пропорциональности нарушается при анализе выживаемости в R
В R, как лучше всего включить член взаимодействия между ковариатой и временем, когда тест пропорциональности (с coxph) показывает, что предположение пропорциональности в модели Кокса нарушено? Я знаю, что вы можете использовать либо страты, либо...
1970 просмотров
r survival-analysis cox-regression survival
schedule 23.07.2022
Использование пакета pec R для прогнозирования на основе функции coxph в наборе данных о легких
Я хочу получить прогнозы для набора данных о легких, доступного из пакета R со штрафными санкциями, используя функцию coxph R для модели пропорциональных рисков Кокса. У меня есть следующий пример кода. library(survival) library(pec)...
1388 просмотров
r survival-analysis cox-regression
schedule 03.12.2022
Как правильно подобрать регрессию Кокса с помощью coxphf? (Метод уменьшения погрешности максимального правдоподобия Фирта в R)
Я пытаюсь подобрать регрессию Кокса (требуется пакет: выживание) и столкнулся с проблемой. Когда я пытаюсь сопоставить «обычную» регрессионную модель Кокса с моими данными, я получаю сообщение об ошибке «Матрица X считается единственной; переменная...
817 просмотров
r survival-analysis cox-regression multivariate-testing
schedule 27.05.2022