Я вызываю функцию R из пакета R e1071, который взаимодействует с libsvm (программа C). Эта функция передает предупреждающие сообщения C (printf) на консоль R. Я знаю это, потому что предупреждающие сообщения имеют форму (предупреждение:...), тогда как предупреждающие сообщения R пишутся с заглавной буквы (т.е. Предупреждение:...).
Я пробовал все, чтобы избавиться от этих сообщений в R (раковина, подавление предупреждений, невидимость), но ничего не работает.
Любые идеи?
Спасибо!
Функция использует stdio вместо Rprintf/REprintf или warning, поэтому перенаправление вывода R не будет работать. Правильное решение — исправить вызовы в libsvm, чтобы вместо этого использовать вывод R.
Взлом вывода stdio возможен — вы можете перенаправить вывод в свой собственный канал и делать с ним все, что хотите, но а) это немного работы на C и б) это опасно, потому что вы необходимо восстановить стандартное поведение после того, как вы закончите работу с функцией - даже если она выдаст ошибку и c) in может взаимодействовать с выводом R, если используется в оболочке.
Если вам нужно действительно странное, грязное, но быстрое решение, запустите свою функцию в collect(parallel(..., silent=TRUE))[[1]] из multicore — она подавляет stdout (вы можете добавить multicore:::closeStderr(), если хотите также подавить stderr). ).
src/svm.cppв исходниках пакетаe1071. - person Josh O'Brien schedule 13.01.2012