Проблемы с графиком скрипки в Python в логарифмическом масштабе

Мои графики скрипки показывают странные форматы при использовании логарифмической шкалы на моих графиках. Я пробовал использовать matplotlib и seaborn и получаю очень похожие результаты.

import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns

data = [[1e-05, 0.00102, 0.00498, 0.09154, 0.02009, 1e-05, 0.06649, 0.42253, 0.02062, 0.10812, 0.07128, 0.03903, 0.00506, 0.13391, 0.08668, 0.04127, 0.00927, 0.00118, 0.063, 0.18392, 0.05948, 0.07774, 0.14018, 0.0133, 0.00339, 0.00271, 0.05233, 0.00054, 0.0593, 1e-05, 0.00076, 0.03409, 0.71491, 0.02311, 0.10246, 0.12491, 0.05164, 0.1553, 0.01079, 0.01734, 0.02239, 0.1347, 0.02877, 0.04752, 0.00333, 0.04553, 0.03189, 0.00947, 0.00158, 0.00888, 0.12663, 0.07531, 0.12367, 0.11346, 0.06638, 0.06154, 1e-05, 0.1838, 0.08659, 0.05654, 0.07658, 0.0348, 0.02954, 0.0123, 0.01529, 0.05559, 0.00416, 0.00038, 0.14142, 0.00164, 0.03671, 0.10609, 0.01209, 0.0024, 0.11718, 0.11224, 0.06032, 0.09632, 0.12216, 0.00087, 0.06746, 0.00433, 0.06836, 0.09928, 2e-05, 0.14116, 0.05718, 0.01196, 0.04297, 0.00709, 0.10535, 0.04772, 0.05691, 0.06277, 1e-05, 0.03917, 0.0026, 0.06763, 0.02083, 0.32244, 0.00561, 0.03399, 0.08146, 0.10606, 0.01482, 0.00339, 0.02275, 0.00685, 0.1536, 0.0592, 0.08869, 1e-05, 0.20489, 0.00094, 0.00714, 0.06355, 0.03414, 0.03002, 0.02365, 0.04376, 0.0246, 0.02745, 0.07604, 0.12069, 1e-05, 0.02974, 0.10681, 0.00987, 0.02543, 0.01416, 0.00098, 3e-05, 0.00967, 0.11958, 0.02882, 0.03634, 0.19232, 0.12058, 0.36535, 0.07428, 0.02829, 0.09189, 0.03677, 0.00036, 0.0463, 0.57029, 0.0105, 0.00015, 0.06212, 0.0329, 0.06102, 0.12267], 
[0.01219, 0.14638, 0.03822, 0.05784, 0.03615, 0.03288, 0.00986, 0.05331, 0.01434, 0.00999, 0.05272, 0.03269, 0.0682, 0.15455, 0.09675, 0.02272, 0.0027, 0.01955, 0.06194, 0.00115, 0.07799, 0.03987, 0.11152, 0.07229, 0.007, 0.00075, 0.04499, 0.01534, 0.04301, 0.01247, 0.09511, 0.02297, 0.05538, 0.04614, 0.07359, 0.06909, 1e-05, 0.04247, 0.05485, 0.00071, 0.082, 0.07614, 0.03751, 0.01625, 0.03309, 0.03228, 0.08109, 0.02171, 0.07246, 0.00353, 0.02434, 0.01394, 0.037, 0.02429, 0.15162, 0.0527, 0.0201, 0.07954, 0.07626, 0.09285, 0.05071, 0.01224, 0.06331, 0.07556, 0.04952, 0.00052, 0.00588, 0.132, 0.00067, 0.00012, 0.00084, 0.03865, 0.02362, 0.08976, 0.18545, 0.04882, 0.03789, 0.05006, 0.02979, 0.003, 0.09262, 0.05668, 0.02486, 0.05855, 0.11588, 0.07713, 0.10428, 0.00706, 0.02467, 0.13257, 0.11547, 0.06143, 0.09478, 0.06099, 0.02483, 0.09312, 0.16867, 0.07236, 0.10962, 0.04149, 0.05005, 0.09087, 0.0313, 0.03697, 0.07201, 2e-05, 0.00259, 0.00115, 0.03907, 0.02931, 0.14907, 0.05598, 0.07087, 0.09709, 0.10653, 0.11936, 0.08196, 0.1213, 0.00627, 0.08496, 0.00038, 0.03537, 0.20043, 0.05159, 0.05872, 0.07754, 0.07621, 0.05924, 0.09587, 0.02653, 0.07135, 1e-05, 0.01377, 0.0062, 0.01965, 0.00115, 0.07529, 0.04709, 0.05458, 0.10895, 0.02195, 0.04534, 0.015, 0.00577, 0.05784, 0.01691, 0.08103, 0.04178, 0.04328, 0.01204, 0.03463, 0.03805, 0.01231, 0.03646, 0.01162, 0.16536, 0.03471, 0.00541, 0.09088, 0.06447, 0.07263, 0.05924, 0.0952, 0.09938, 0.04464, 0.05543, 0.03827, 0.11514, 0.02803, 0.09589, 0.0254, 0.05351, 0.00171, 0.00856, 0.05828, 0.11975, 7e-05, 0.07093, 0.06077, 0.0384, 0.00163, 0.05992, 0.00463, 0.00975, 0.00429, 0.12965, 0.03388, 0.02372, 0.07622, 0.04341, 0.06637, 0.00578, 0.06946, 0.00469, 0.11668, 0.07033, 0.06806, 0.05505, 0.02195, 0.05089, 0.03404, 0.00552, 0.05331, 0.03695, 0.41581, 0.01553, 0.02045, 0.09779, 0.03842, 0.01115, 0.05392, 0.01147, 0.05855, 0.05588, 0.20745, 0.01536, 0.03993, 0.07677, 0.01388, 0.0029, 0.00235, 0.05823, 0.05237, 0.00425, 0.09225, 0.00703, 0.24038, 0.06733, 0.00064, 0.08959, 0.04365, 0.02308, 0.04566, 0.08395, 0.0038, 0.05322, 0.0145, 0.02012, 0.07084, 0.08202, 0.01091, 0.03738, 0.03798, 0.03473, 0.08534, 0.00133, 0.04046, 0.10119, 0.0317, 0.00312, 0.03614, 0.10442, 0.13286, 0.0042, 0.04229, 0.01735, 0.09879, 0.07516, 0.00303, 0.08062, 0.09347, 0.03473, 0.05099, 0.16373, 0.08988, 0.04696, 0.07488, 0.12159, 0.11098, 0.00549, 0.00122, 0.05276, 0.09883, 0.01346, 0.02059, 0.07394, 0.0413, 0.08766, 0.0124, 0.09913, 0.00754, 0.15671, 0.02699, 0.09978, 1e-05, 0.00243, 0.02819, 0.00027, 0.05793, 0.03165, 0.10168, 0.00042, 0.00044, 0.01332, 0.00542, 0.05946, 0.009, 0.10857, 0.01699, 1e-05, 0.00073, 0.10842, 0.17143, 0.00036, 0.00014, 0.10508, 0.01333, 0.34202, 0.12201, 0.04618, 0.02507, 0.02939, 0.03497, 0.01905, 0.00136, 0.02354, 0.00061, 0.08514, 0.14529, 0.04097, 0.12821, 0.18862], 
[0.04683, 0.02943, 0.07885, 0.07846, 0.06855, 0.02815, 0.00792, 0.0826, 0.00554, 0.01041, 0.03957, 0.0126, 0.08399, 0.15046, 0.15594, 0.03941, 0.0428, 0.11343, 0.15665, 0.07381, 0.04386, 0.12008, 0.04816, 0.04844, 0.08248, 0.08023, 0.03011, 0.00464, 0.07204, 0.08376, 0.05777, 0.06164, 0.00697, 0.02023, 0.04844, 0.0592, 0.00954, 0.06357, 0.0122, 0.05905, 0.00705, 0.0054, 0.08822, 0.06056, 0.02598, 0.02136, 0.05638, 0.03768, 0.05101, 0.08908, 0.0384, 0.01579, 0.04023, 0.03746, 0.17236, 0.08293, 0.12469, 0.14018, 0.04301, 0.07258, 0.02678, 0.08078, 0.07698, 0.06346, 0.06984, 0.04832, 0.07512, 0.0342, 0.05339, 0.026, 0.11585, 0.02744, 0.00979, 0.01312, 0.05915, 0.01326, 0.00107, 0.00737, 0.05971, 0.0451, 0.05788, 0.0007, 0.0043, 0.00142, 0.0019, 0.00055, 0.00223, 0.02441, 0.04555, 0.03869, 0.05791, 0.05517, 0.15743, 0.04517, 0.47114, 0.05639, 0.00152, 0.00371, 1e-05, 1e-05, 0.04192, 0.02758, 0.01945, 0.02763, 0.04021, 0.02844, 0.01823, 0.10665, 0.02067, 0.05433, 0.05591, 0.00733, 0.00858, 0.01949, 0.06519, 0.07793, 0.00199, 0.09916, 0.08717, 0.06273, 0.09408, 0.00638, 0.00248, 0.08922, 0.09157, 0.03525, 0.01791, 0.06016, 0.01939, 0.12194, 0.08303, 0.0831, 0.02714, 0.06312, 0.11584, 0.11334, 0.04314, 0.02575, 0.00629, 0.02408, 0.02274, 0.03037, 0.06737, 0.0175, 0.00888, 0.06568, 0.0839, 0.0085, 0.00831, 0.00154, 0.01072, 0.01289, 0.09074, 0.02131, 0.02997, 0.02343, 0.02355, 0.05324, 0.09564, 0.17995, 0.00828, 0.0148, 0.01858, 0.02106, 0.00288, 0.00344, 0.001, 0.02143, 0.00732, 0.01458, 0.01547, 0.01742, 0.00032, 0.24005, 0.00028, 0.00302, 0.07275, 0.04579, 0.06316, 0.02572, 0.09316, 0.03062, 0.10521, 0.07123, 0.03069, 0.07958, 0.04484, 0.01948, 0.01951, 0.01282, 0.00868, 0.07931, 0.01105, 0.01235, 0.09297, 0.06959, 0.00716, 0.0271, 0.00592, 0.09362, 0.00319, 0.00859, 0.08486, 0.02001, 0.00194, 0.04189, 0.09024, 0.07705, 0.07365, 0.01123, 0.03202, 0.01361, 0.00098, 0.00397, 0.00139, 0.00397, 0.00445, 1e-05, 0.00267, 0.06564, 0.06567, 0.06566, 0.06566, 0.09249, 0.03475, 0.0338, 0.0664, 0.02986, 0.04024, 0.00835, 0.04304, 0.04081, 0.04534, 0.06636, 0.03312, 0.06175, 0.03117, 0.02243, 0.03454, 0.11135, 0.07016, 0.0681, 0.09716, 0.02589, 0.4367, 0.08293, 0.11834, 0.00191, 0.10913, 0.00159, 0.0638, 0.01808, 0.00116, 0.00911, 0.01408, 0.09179, 0.02122, 0.05026, 0.05144, 0.03169, 0.06674]]

fig, ax = plt.subplots(1,3, sharey=True)
sns.violinplot(data=data, ax=ax[0])
sns.swarmplot(data=data, ax=ax[1])
sns.stripplot(data=data, ax=ax[2])

При использовании данных в линейном масштабе все выглядит нормально. введите описание изображения здесь Однако многие мои данные находятся в диапазоне от 0,1 до 0,00001, поэтому я хотел использовать логарифмическую шкалу для лучшей визуализации.

При переходе на логарифмическую шкалу:

plt.yscale('log')
plt.ylim(0.000001, 1)

Мои графики роя и полосы выглядят нормально, однако графики скрипки не сгущаются к низу. Обратите внимание, что у меня также нет отрицательных значений, но графики скрипки всегда предполагают, что у меня есть.

введите здесь описание изображения

В целом, я ожидал, что мои скрипичные сюжеты будут выглядеть примерно так (что было сделано в R).

введите здесь описание изображения

Любые предложения о том, как заставить графики скрипки действовать больше как графики на последнем изображении (т.е. сгущаться, когда точек данных меньше), используя seaborn или matplotlib, или другую визуализацию на основе python?


person Stephen Wyka    schedule 08.02.2020    source источник


Ответы (2)


Другой вариант, который можно попробовать, — преобразовать данные.

Метки галочек для оси Y можно переписать с помощью специального средства форматирования. Также могут быть сгенерированы незначительные тики, похожие на логарифмический график.

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import ticker as mticker
import seaborn as sns
import numpy as np

data = [[1e-05, 0.00102, 0.00498, 0.09154, 0.02009, 1e-05, 0.06649, 0.42253, 0.02062, 0.10812, 0.07128, 0.03903, 0.00506, 0.13391, 0.08668, 0.04127, 0.00927, 0.00118, 0.063, 0.18392, 0.05948, 0.07774, 0.14018, 0.0133, 0.00339, 0.00271, 0.05233, 0.00054, 0.0593, 1e-05, 0.00076, 0.03409, 0.71491, 0.02311, 0.10246, 0.12491, 0.05164, 0.1553, 0.01079, 0.01734, 0.02239, 0.1347, 0.02877, 0.04752, 0.00333, 0.04553, 0.03189, 0.00947, 0.00158, 0.00888, 0.12663, 0.07531, 0.12367, 0.11346, 0.06638, 0.06154, 1e-05, 0.1838, 0.08659, 0.05654, 0.07658, 0.0348, 0.02954, 0.0123, 0.01529, 0.05559, 0.00416, 0.00038, 0.14142, 0.00164, 0.03671, 0.10609, 0.01209, 0.0024, 0.11718, 0.11224, 0.06032, 0.09632, 0.12216, 0.00087, 0.06746, 0.00433, 0.06836, 0.09928, 2e-05, 0.14116, 0.05718, 0.01196, 0.04297, 0.00709, 0.10535, 0.04772, 0.05691, 0.06277, 1e-05, 0.03917, 0.0026, 0.06763, 0.02083, 0.32244, 0.00561, 0.03399, 0.08146, 0.10606, 0.01482, 0.00339, 0.02275, 0.00685, 0.1536, 0.0592, 0.08869, 1e-05, 0.20489, 0.00094, 0.00714, 0.06355, 0.03414, 0.03002, 0.02365, 0.04376, 0.0246, 0.02745, 0.07604, 0.12069, 1e-05, 0.02974, 0.10681, 0.00987, 0.02543, 0.01416, 0.00098, 3e-05, 0.00967, 0.11958, 0.02882, 0.03634, 0.19232, 0.12058, 0.36535, 0.07428, 0.02829, 0.09189, 0.03677, 0.00036, 0.0463, 0.57029, 0.0105, 0.00015, 0.06212, 0.0329, 0.06102, 0.12267],
[0.01219, 0.14638, 0.03822, 0.05784, 0.03615, 0.03288, 0.00986, 0.05331, 0.01434, 0.00999, 0.05272, 0.03269, 0.0682, 0.15455, 0.09675, 0.02272, 0.0027, 0.01955, 0.06194, 0.00115, 0.07799, 0.03987, 0.11152, 0.07229, 0.007, 0.00075, 0.04499, 0.01534, 0.04301, 0.01247, 0.09511, 0.02297, 0.05538, 0.04614, 0.07359, 0.06909, 1e-05, 0.04247, 0.05485, 0.00071, 0.082, 0.07614, 0.03751, 0.01625, 0.03309, 0.03228, 0.08109, 0.02171, 0.07246, 0.00353, 0.02434, 0.01394, 0.037, 0.02429, 0.15162, 0.0527, 0.0201, 0.07954, 0.07626, 0.09285, 0.05071, 0.01224, 0.06331, 0.07556, 0.04952, 0.00052, 0.00588, 0.132, 0.00067, 0.00012, 0.00084, 0.03865, 0.02362, 0.08976, 0.18545, 0.04882, 0.03789, 0.05006, 0.02979, 0.003, 0.09262, 0.05668, 0.02486, 0.05855, 0.11588, 0.07713, 0.10428, 0.00706, 0.02467, 0.13257, 0.11547, 0.06143, 0.09478, 0.06099, 0.02483, 0.09312, 0.16867, 0.07236, 0.10962, 0.04149, 0.05005, 0.09087, 0.0313, 0.03697, 0.07201, 2e-05, 0.00259, 0.00115, 0.03907, 0.02931, 0.14907, 0.05598, 0.07087, 0.09709, 0.10653, 0.11936, 0.08196, 0.1213, 0.00627, 0.08496, 0.00038, 0.03537, 0.20043, 0.05159, 0.05872, 0.07754, 0.07621, 0.05924, 0.09587, 0.02653, 0.07135, 1e-05, 0.01377, 0.0062, 0.01965, 0.00115, 0.07529, 0.04709, 0.05458, 0.10895, 0.02195, 0.04534, 0.015, 0.00577, 0.05784, 0.01691, 0.08103, 0.04178, 0.04328, 0.01204, 0.03463, 0.03805, 0.01231, 0.03646, 0.01162, 0.16536, 0.03471, 0.00541, 0.09088, 0.06447, 0.07263, 0.05924, 0.0952, 0.09938, 0.04464, 0.05543, 0.03827, 0.11514, 0.02803, 0.09589, 0.0254, 0.05351, 0.00171, 0.00856, 0.05828, 0.11975, 7e-05, 0.07093, 0.06077, 0.0384, 0.00163, 0.05992, 0.00463, 0.00975, 0.00429, 0.12965, 0.03388, 0.02372, 0.07622, 0.04341, 0.06637, 0.00578, 0.06946, 0.00469, 0.11668, 0.07033, 0.06806, 0.05505, 0.02195, 0.05089, 0.03404, 0.00552, 0.05331, 0.03695, 0.41581, 0.01553, 0.02045, 0.09779, 0.03842, 0.01115, 0.05392, 0.01147, 0.05855, 0.05588, 0.20745, 0.01536, 0.03993, 0.07677, 0.01388, 0.0029, 0.00235, 0.05823, 0.05237, 0.00425, 0.09225, 0.00703, 0.24038, 0.06733, 0.00064, 0.08959, 0.04365, 0.02308, 0.04566, 0.08395, 0.0038, 0.05322, 0.0145, 0.02012, 0.07084, 0.08202, 0.01091, 0.03738, 0.03798, 0.03473, 0.08534, 0.00133, 0.04046, 0.10119, 0.0317, 0.00312, 0.03614, 0.10442, 0.13286, 0.0042, 0.04229, 0.01735, 0.09879, 0.07516, 0.00303, 0.08062, 0.09347, 0.03473, 0.05099, 0.16373, 0.08988, 0.04696, 0.07488, 0.12159, 0.11098, 0.00549, 0.00122, 0.05276, 0.09883, 0.01346, 0.02059, 0.07394, 0.0413, 0.08766, 0.0124, 0.09913, 0.00754, 0.15671, 0.02699, 0.09978, 1e-05, 0.00243, 0.02819, 0.00027, 0.05793, 0.03165, 0.10168, 0.00042, 0.00044, 0.01332, 0.00542, 0.05946, 0.009, 0.10857, 0.01699, 1e-05, 0.00073, 0.10842, 0.17143, 0.00036, 0.00014, 0.10508, 0.01333, 0.34202, 0.12201, 0.04618, 0.02507, 0.02939, 0.03497, 0.01905, 0.00136, 0.02354, 0.00061, 0.08514, 0.14529, 0.04097, 0.12821, 0.18862],
[0.04683, 0.02943, 0.07885, 0.07846, 0.06855, 0.02815, 0.00792, 0.0826, 0.00554, 0.01041, 0.03957, 0.0126, 0.08399, 0.15046, 0.15594, 0.03941, 0.0428, 0.11343, 0.15665, 0.07381, 0.04386, 0.12008, 0.04816, 0.04844, 0.08248, 0.08023, 0.03011, 0.00464, 0.07204, 0.08376, 0.05777, 0.06164, 0.00697, 0.02023, 0.04844, 0.0592, 0.00954, 0.06357, 0.0122, 0.05905, 0.00705, 0.0054, 0.08822, 0.06056, 0.02598, 0.02136, 0.05638, 0.03768, 0.05101, 0.08908, 0.0384, 0.01579, 0.04023, 0.03746, 0.17236, 0.08293, 0.12469, 0.14018, 0.04301, 0.07258, 0.02678, 0.08078, 0.07698, 0.06346, 0.06984, 0.04832, 0.07512, 0.0342, 0.05339, 0.026, 0.11585, 0.02744, 0.00979, 0.01312, 0.05915, 0.01326, 0.00107, 0.00737, 0.05971, 0.0451, 0.05788, 0.0007, 0.0043, 0.00142, 0.0019, 0.00055, 0.00223, 0.02441, 0.04555, 0.03869, 0.05791, 0.05517, 0.15743, 0.04517, 0.47114, 0.05639, 0.00152, 0.00371, 1e-05, 1e-05, 0.04192, 0.02758, 0.01945, 0.02763, 0.04021, 0.02844, 0.01823, 0.10665, 0.02067, 0.05433, 0.05591, 0.00733, 0.00858, 0.01949, 0.06519, 0.07793, 0.00199, 0.09916, 0.08717, 0.06273, 0.09408, 0.00638, 0.00248, 0.08922, 0.09157, 0.03525, 0.01791, 0.06016, 0.01939, 0.12194, 0.08303, 0.0831, 0.02714, 0.06312, 0.11584, 0.11334, 0.04314, 0.02575, 0.00629, 0.02408, 0.02274, 0.03037, 0.06737, 0.0175, 0.00888, 0.06568, 0.0839, 0.0085, 0.00831, 0.00154, 0.01072, 0.01289, 0.09074, 0.02131, 0.02997, 0.02343, 0.02355, 0.05324, 0.09564, 0.17995, 0.00828, 0.0148, 0.01858, 0.02106, 0.00288, 0.00344, 0.001, 0.02143, 0.00732, 0.01458, 0.01547, 0.01742, 0.00032, 0.24005, 0.00028, 0.00302, 0.07275, 0.04579, 0.06316, 0.02572, 0.09316, 0.03062, 0.10521, 0.07123, 0.03069, 0.07958, 0.04484, 0.01948, 0.01951, 0.01282, 0.00868, 0.07931, 0.01105, 0.01235, 0.09297, 0.06959, 0.00716, 0.0271, 0.00592, 0.09362, 0.00319, 0.00859, 0.08486, 0.02001, 0.00194, 0.04189, 0.09024, 0.07705, 0.07365, 0.01123, 0.03202, 0.01361, 0.00098, 0.00397, 0.00139, 0.00397, 0.00445, 1e-05, 0.00267, 0.06564, 0.06567, 0.06566, 0.06566, 0.09249, 0.03475, 0.0338, 0.0664, 0.02986, 0.04024, 0.00835, 0.04304, 0.04081, 0.04534, 0.06636, 0.03312, 0.06175, 0.03117, 0.02243, 0.03454, 0.11135, 0.07016, 0.0681, 0.09716, 0.02589, 0.4367, 0.08293, 0.11834, 0.00191, 0.10913, 0.00159, 0.0638, 0.01808, 0.00116, 0.00911, 0.01408, 0.09179, 0.02122, 0.05026, 0.05144, 0.03169, 0.06674]]

log_data = [[np.log10(d) for d in row] for row in data]

fig, ax = plt.subplots(1, 3, sharey=True)
sns.violinplot(data=log_data, ax=ax[0])
sns.swarmplot(data=log_data, ax=ax[1])
sns.stripplot(data=log_data, ax=ax[2])
ax[0].yaxis.set_major_formatter(mticker.StrMethodFormatter("$10^{{{x:.0f}}}$"))
ax[0].yaxis.set_ticks([np.log10(x) for p in range(-6,1) for x in np.linspace(10**p, 10**(p+1), 10)], minor=True)
plt.show()

Это должно показать ожидаемый сюжет.

пример участка

person JohanC    schedule 08.02.2020
comment
Спасибо, думаю, я воспользуюсь этим. Я подумал, что могу просто изменить метки оси Y (как вы только что сделали). - person Stephen Wyka; 09.02.2020

Я не знаю, что здесь с seaborn, но скрипичный сюжет из matplotlib, кажется, работает, как и ожидалось.

fig, ax = plt.subplots(1,3, sharey=True)

ax[0].violinplot(dataset=data) # <------- matplotlib's violinplot here
sns.swarmplot(data=data, ax=ax[1])
sns.stripplot(data=data, ax=ax[2])

plt.yscale('log')
plt.ylim(10**(-6), 10**0)

введите здесь описание изображения

person Sheldore    schedule 08.02.2020
comment
Да, matplotlib работает немного лучше, но, судя по стрипплотам, я ожидал большего ограничения в диапазоне от 10-3 до 10-5. - person Stephen Wyka; 09.02.2020
comment
KDE рассчитывается в линейном пространстве и использует постоянное ядро, поэтому нельзя ожидать, что он покажет что-то похожее на график R, показанный в вопросе. Вычисление KDE в logspace приведет к что-то вроде этого с вашими данными, потому что большинство очков по-прежнему находится в диапазоне 10 ^ (-2). - person ImportanceOfBeingErnest; 09.02.2020
comment
Ну, это выглядит более подходящим для данных, не могли бы вы рассказать, как вы рассчитали KDE в лог-пространстве? - person Stephen Wyka; 09.02.2020