Я строю тепловую карту с помощью пакета pheatmap в r.
Я применил функцию display_numbers для отображения значений в матрице на тепловой карте и получил:
У меня так много NA в моей матрице, и я хотел бы скрыть их в тепловой карте, как я могу это сделать?
Во-первых, людям будет намного проще помочь вам, если вы предоставите воспроизводимые и минимальные образцы данных. Пожалуйста, ознакомьтесь с тем, как предоставить минимальный воспроизводимый пример/попытку для будущих постов.
Что касается вашего вопроса:
Давайте сгенерируем некоторые образцы данных
set.seed(2018)
mat <- matrix(runif(20), 4, 5)
Мы используем вторую матрицу для отображения значений через аргумент display_numbers из pheatmap. Здесь мы просто копируем исходную матрицу и случайным образом генерируем несколько значений NA:
mat2 <- mat
mat2[mat2 < 0.5] <- NA
Теперь мы заменяем значения NA пустыми строками.
mat2[is.na(mat2)] <- ""
Покажем тепловую карту
pheatmap(mat, display_numbers = mat2)
dput(head(mysampledata,20)), чтобы добавить примеры данных к своему вопросу. - person NelsonGon schedule 25.12.2018