SQL возвращает неправильное количество строк

Средство чтения данных не знает, сколько строк будет возвращено вашим запросом на выборку, пока не прочитает все данные из базового потока, поступающего из базы данных.

Свойство FieldCount возвращает количество полей в вашем запросе, и оно ровно одно для вашего текущего запроса.

Чтобы узнать строки, вам нужно прочитать их одну за другой или использовать DataTable

int numRows = 0;
while(r.Read())
{
    // do your task with the current IDataRecord
    numRows++;
}

Console.WriteLine($"There are {numRows} rows");

Или заполнение DataTable

DataTable dt = new DataTable();
dt.Load(com.ExecuteReader());
Console.WriteLine($"There are {dt.Rows.Count} rows");

Два приведенных выше метода полезны, если вы планируете использовать возвращаемые данные (в массиве считывателя или в массиве строк таблицы), но если вы просто хотите узнать, сколько существует строк, то это лучше (хотя и минимально, когда возвращаются только две строки). ), чтобы изменить запрос на:

com.CommandText = @"SELECT COUNT(*) FROM PassageOption AS PO 
                    WHERE PO.PassageID_FK = @passageID;";
com.Parameters.AddWithValue("@passageID", passageID);
int numRows = (int)com.ExecuteScalar();

Читатель не нужен, если вам нужна одна строка с одним полем, просто ExecuteScalar

EDIT, чтобы обновить последнее редактирование

Эта строка не работает

optionIDs[i] = (int)r[i]; 

потому что у вас есть только одно поле в вашем запросе. Индексатор i следует использовать только для ссылки на массив optionIDs, чтобы не извлекать поле в позиции 1 из средства чтения. В позиции 1 нет поля, просто используйте

optionIDs[i] = (int)r[0]; 

за каждый вызов чтения

int numRows = r.FieldCount;

Свойство FieldCount получает количество столбцов в строке, а не количество записей.

Вы выбираете только OptionID_FK одного столбца из таблицы. FieldCount покажет вам 1.

Получить нет. строк

OleDbDataReader r = com.ExecuteReader();
int rowCount = 0;
if (r.HasRows)  
{  
    while (r.Read())  
    {  
       rowCount++;     
    }  
}
r.Close(); 

В вашем считывателе данных есть только один столбец, выбранный вами столбец PO.OptionID_FK. Поэтому в вашем цикле, когда i равно 1:

optionIDs[i] = (int)r[i]; // It gives me the following error, the second time it runs, when i = 1; System.IndexOutOfRangeException: 'Index was outside the bounds of the array.'

...вы пытаетесь выбрать второй столбец из модуля чтения данных (r[i]), которого не существует.

Способ работы DataReader заключается в том, что всякий раз, когда вы выполняете r.read, вы перемещаетесь на следующую строку, а ваша переменная r "массив" обновляется со всеми значениями столбца из новой строки. Индекс массива r[n] выбирает n-й столбец средства чтения, а не n-ю строку. Поэтому вы должны просто использовать:

optionIDs[i] = (int)r[0];

... который установит значение optionIDs со значением первого (нулевого) столбца DataReader для текущей строки.