Мне потребовалось некоторое время, чтобы понять это, поэтому я решил оставить некоторые инструкции о том, как я это сделал, на случай, если кто-то еще столкнется с теми же проблемами.
Мне нужно было разрешить доступ к каталогу .well-known в Express, чтобы иметь возможность использовать certbot для создания SSL-сертификатов.