Можно ли использовать переменные в httpd.conf

Да вроде. Вы можете заменить переменные среды в файле конфигурации при запуске с помощью синтаксиса ${ENVVAR}. Вам решать, как установить эти переменные перед запуском сервера.

http://httpd.apache.org/docs/2.2/configuring.html#syntax

Обратите внимание, что эти переменные будут сохраняться, поэтому любые скрипты на таких языках, как php, смогут их прочитать.

Также важно отметить, что эти значения интерпретируются только один раз при запуске сервера, поэтому они больше похожи на константы, чем на переменные.

Обновлять

Начиная с httpd версии 2.4, вместо этого см. этот ответ: https://stackoverflow.com/a/15731921/498798

Попробуйте мод_макро. Это фактически позволяет вам использовать то, что по существу является переменными. Пример из страницы документации модуля дает представление о нем:

## Define a VHost Macro for repetitive configurations

<Macro VHost $host $port $dir>
  Listen $port
  <VirtualHost *:$port>

    ServerName $host
    DocumentRoot $dir

    <Directory $dir>
      # do something here...
    </Directory>

    # limit access to intranet subdir.
    <Directory $dir/intranet>
      Require ip 10.0.0.0/8
    </Directory>
  </VirtualHost>
</Macro>

## Use of VHost with different arguments.

Use VHost www.apache.org 80 /vhosts/apache/htdocs
Use VHost example.org 8080 /vhosts/example/htdocs
Use VHost www.example.fr 1234 /vhosts/example.fr/htdocs

Я нашел его для загрузки по адресу http://www.cri.ensmp.fr/~coelho/mod_macro/