Вывод большого участка леса с помощью пакета r forestplot

Я делаю лесной участок в r, используя пакет forestplot (см. https://cran.r-project.org/web/packages/forestplot/forestplot.pdf).

Сюжет меня устраивает, но проблема в том, что разрешение недостаточно высокое. Я пробовал разные вещи, чтобы увеличить размер графика, но что бы я ни делал, общая площадь графика всегда остается неизменной (даже если я могу изменить размер текста и т. Д.).

Я привожу пару цифр, чтобы проиллюстрировать свою точку зрения. Второй просто создается путем установки параметров ширины и высоты функции tiff в два раза больше, чем у первого рисунка. Обычно это приводит к тому, что график растягивается по всей области, но, похоже, здесь не так, а второе изображение получает только широкие белые поля.

введите описание изображения здесь

И второй:  введите описание изображения здесь

Код выглядит следующим образом:

library(rmeta)
 tiff("/mypath", width=480*multifactor, height = 480*multifactor)

forestplot(tabletext,m,l,u,zero=0,is.summary=c(TRUE,FALSE,TRUE,rep(FALSE,(nrow(input)+1)),TRUE,TRUE,TRUE),clip=c(log(0.5),log(32)), xlog=TRUE,xlab="RR",xticks=c(0.5,1,2,4,8,16,32),col=meta.colors(box="royalblue",line="darkblue", summary="royalblue"))

dev.off()   

И вот (немного беспорядочный) воспроизводимый пример:

tabletext <-
structure(c("mock test", NA, "Site", "A", "B", "C", "D", "E", 
"F", "G", "H", "I", "J", "K", NA, NA, "All", "  ", "  ", "  ", 
"  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", 
"  ", "  ", "  ", NA, NA, "Aff", "37", "140", "114", "34", "185", 
"184", "26", "161", "90", "106", "191", NA, "RR", "1.61", NA, 
NA, "Ctrl", "48", "152", "36", "80", "168", "191", "44", "86", 
"15", "127", "74", NA, NA, NA, NA, NA, "RR", "7", "3", "4", "5", 
"3", "4", "8", "2", "2", "3", "7", NA, NA, NA, "  ", "  ", "  ", 
"  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", 
"  ", "CI95%", "(1.31-1.97)", NA, NA, "P", "0.1", "0.1", "0.1", 
"0.1", "0.1", "0.1", "0.1", "0.1", "0.1", "0.1", "0.1", NA, "P", 
"0.02", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", 
"  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  ", "  "), .Dim = c(17L, 
8L), .Dimnames = list(NULL, c("plot_col1", "plot_col2", "plot_col3", 
"plot_col4", "plot_col5", "plot_col6", "plot_col7", "plot_col8"
)))

m <-
c(NA, NA, NA, 2.07944154167984, 1.6094379124341, 1.79175946922805, 
1.94591014905531, 1.09861228866811, 1.79175946922805, 1.09861228866811, 
2.07944154167984, 1.38629436111989, 0.693147180559945, 1.09861228866811, 
NA, NA, 0.476234178996372)

l <-
c(NA, NA, NA, 1.79175946922805, 1.6094379124341, 1.79175946922805, 
0.693147180559945, 1.09861228866811, 1.6094379124341, -Inf, -Inf, 
1.38629436111989, 1.79175946922805, 0, NA, NA, 0.27002713721306
)

u <-
c(NA, NA, NA, 2.19722457733622, 2.19722457733622, 2.30258509299405, 
2.07944154167984, 2.07944154167984, 2.19722457733622, 2.30258509299405, 
2.07944154167984, 1.6094379124341, 2.30258509299405, 1.94591014905531, 
NA, NA, 0.678033542749897)

Спасибо за помощь.


person Sigurgeir    schedule 03.03.2017    source источник
comment
Отсутствует куча объектов, а именно m, l, u и input. Откуда meta.colors?   -  person Roman Luštrik    schedule 03.03.2017
comment
Спасибо. Я исправил это.   -  person Sigurgeir    schedule 03.03.2017
comment
В примере вы используете пакет rmeta, а не пакет forestplot, упомянутый во вступлении.   -  person Max Gordon    schedule 18.10.2017


Ответы (1)


Я не могу воспроизвести ваш пример, но вы пытались включить 'res'?

tiff("test.tiff", width=480*multifactor, height = 480*multifactor, res=300)
forestplot(...)
dev.off()
person Thomas Zelniker    schedule 20.08.2018