У меня есть эти последовательности:
GCAGGCATAGTCGGAACTGCTCTAAGCCTATTAATTCGAGCTGAGCTAAGCCAGCCTGGGGCTCTGCTCGGAGATGA
AGTGGGCTTGTTGGGACTGGTCTTTCTTTATTAATTCGTTTTGAGTTAGGCACTGTTGGAGTTTTATTAG---ATAA
GCAGGAATAGTTGGAACCGCCCTTAGCTTATTAATTCGAGCAGAACTCAGCCAACCTGGTGCCTTATTAGGGGATGA
GCTGGCATAGTAGGAACTGCCCTTAGCCTTTTAATTCGAGCAGAGCTCAGTCAACCCGGAGCCCTGCTCGGAGATGA
GCAGGAATAGTTGGAACTGCACTAAGCCTTTTAATTCGAGCTGAACTAAGCCAACCCGGAGCATTACTTGGAGACGA
Они были бы на самом деле длиннее, но правильно не это не важно.
Я хотел бы оценить заданное значение для последовательностей с учетом количества мотивов в.
Я хотел бы подсчитать (количество) мотивов, таких как "ATCGCGCGCGCTTTAAA", в заданной последовательности, а затем использовать это число для оценки значения этой последовательности.
Я знаю, что вы можете использовать логический вопрос, чтобы узнать, есть ли в данной последовательности мотив, но я хотел бы сосчитать их.
Спасибо
