Ирис для Анаконды, не читает .гриб

Я только что скачал Iris и пытаюсь просмотреть содержимое файла .grib. Я попробовал очень простой фрагмент кода ниже, но получил набор ошибок. Может ли кто-нибудь увидеть, что может быть причиной проблем?

Спасибо

import iris

fn='C:\Users\mmso2\Desktop\grib files ECMWF\2006\_mars-atls17-95e2cf679cd58ee9b4db4dd119a05a8d-GOnSTm.grib'
cubes = iris.load(fn)

ошибки:

C:\Anaconda2\python.exe "C:/Users/mmso2/Google Drive/MABL Wind/_Semester 2 2016/_PGR Training/CENTA/MATLAB/In class ex/SAR_data/grib_files_check.py"
Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/mmso2/Google Drive/MABL Wind/_Semester 2 2016/_PGR Training/CENTA/MATLAB/In class ex/SAR_data/grib_files_check.py", line 2, in <module>
    import iris
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\iris\__init__.py", line 110, in <module>
    import iris.cube
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\iris\cube.py", line 39, in <module>
    import iris.analysis
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\iris\analysis\__init__.py", line 61, in <module>
    from iris.analysis._area_weighted import AreaWeightedRegridder
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\iris\analysis\_area_weighted.py", line 23, in <module>
    from iris.analysis._interpolation import get_xy_dim_coords, snapshot_grid
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\iris\analysis\_interpolation.py", line 31, in <module>
    from iris.analysis.cartography import wrap_lons as wrap_circular_points
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\iris\analysis\cartography.py", line 29, in <module>
    import cf_units
  File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\cf_units\__init__.py", line 394, in <module>
    _status_msg, _error_msg))
OSError: [UT_OPEN_ARG] Failed to open UDUNITS-2 XML unit database : "No such file or directory"

Process finished with exit code 1

Обновление: среда Conda

# packages in environment at C:\Anaconda2:
#
Using Anaconda Cloud api site https://api.anaconda.org
alabaster                 0.7.7                    py27_0    defaults
anaconda                  4.0.0               np110py27_0    defaults
anaconda-client           1.4.0                    py27_0    defaults
anaconda-navigator        1.1.0                    py27_0    defaults
basemap                   1.0.7               np110py27_0    anaconda
argcomplete               1.0.0                    py27_1    defaults
astropy                   1.1.2               np110py27_0    defaults
babel                     2.2.0                    py27_0    defaults
backports_abc             0.4                      py27_0    defaults
beautifulsoup4            4.4.1                    py27_0    defaults
bitarray                  0.8.1                    py27_1    defaults
blaze                     0.9.1                    py27_0    defaults
bokeh                     0.11.1                   py27_0    defaults
boto                      2.39.0                   py27_0    defaults
bottleneck                1.0.0               np110py27_0    defaults
bzip2                     1.0.6                     vc9_2  [vc9]  defaults
cdecimal                  2.3                      py27_1    defaults
cffi                      1.5.2                    py27_0    defaults
chest                     0.2.3                    py27_0    defaults
cloudpickle               0.1.1                    py27_0    defaults
clyent                    1.2.1                    py27_0    defaults
colorama                  0.3.7                    py27_0    defaults
comtypes                  1.1.2                    py27_0    defaults
conda                     4.1.11                   py27_0    defaults
conda-build               1.20.0                   py27_0    defaults
conda-env                 2.5.2                    py27_0    defaults
conda-manager             0.3.1                    py27_0    defaults
configobj                 5.0.6                    py27_0    defaults
console_shortcut          0.1.1                    py27_1    defaults
cryptography              1.3                      py27_0    defaults
curl                      7.45.0                    vc9_1  [vc9]  defaults
cycler                    0.10.0                   py27_0    defaults
cython                    0.23.4                   py27_0    defaults
cytoolz                   0.7.5                    py27_0    defaults
dask                      0.8.1                    py27_0    defaults
datashape                 0.5.1                    py27_0    defaults
decorator                 4.0.9                    py27_0    defaults
dill                      0.2.4                    py27_0    defaults
docutils                  0.12                     py27_1    defaults
ecmwf-api-client          1.4.1                     <pip>
enum34                    1.1.2                    py27_0    defaults
et_xmlfile                1.0.1                    py27_0    defaults
fastcache                 1.0.2                    py27_0    defaults
flask                     0.10.1                   py27_1    defaults
flask-cors                2.1.2                    py27_0    defaults
freetype                  2.5.5                     vc9_0  [vc9]  defaults
funcsigs                  0.4                      py27_0    defaults
futures                   3.0.3                    py27_0    defaults
geos                      3.5.0                     vc9_0  [vc9]  defaults
gevent                    1.1.0                    py27_0    defaults
greenlet                  0.4.9                    py27_0    defaults
grin                      1.2.1                    py27_2    defaults
h5py                      2.5.0               np110py27_4    defaults
hdf5                      1.8.15.1                  vc9_4  [vc9]  defaults
heapdict                  1.0.0                    py27_0    defaults
idna                      2.0                      py27_0    defaults
ipaddress                 1.0.14                   py27_0    defaults
ipykernel                 4.3.1                    py27_0    defaults
ipython                   4.1.2                    py27_1    defaults
ipython_genutils          0.1.0                    py27_0    defaults
ipywidgets                4.1.1                    py27_0    defaults
itsdangerous              0.24                     py27_0    defaults
jdcal                     1.2                      py27_0    defaults
jedi                      0.9.0                    py27_0    defaults
jinja2                    2.8                      py27_0    defaults
jpeg                      8d                        vc9_0  [vc9]  defaults
jsonschema                2.4.0                    py27_0    defaults
jupyter                   1.0.0                    py27_2    defaults
jupyter_client            4.2.2                    py27_0    defaults
jupyter_console           4.1.1                    py27_0    defaults
jupyter_core              4.1.0                    py27_0    defaults
libpng                    1.6.17                    vc9_1  [vc9]  defaults
libsodium                 1.0.3                         0    defaults
libtiff                   4.0.6                     vc9_1  [vc9]  defaults
llvmlite                  0.9.0                    py27_0    defaults
locket                    0.2.0                    py27_0    defaults
lxml                      3.6.0                    py27_0    defaults
markupsafe                0.23                     py27_1    defaults
matplotlib                1.5.1               np110py27_0    defaults
menuinst                  1.3.2                    py27_0    defaults
mistune                   0.7.2                    py27_0    defaults
mkl                       11.3.1                        0    defaults
mkl-service               1.1.2                    py27_0    defaults
mock                      1.3.0                    py27_0    defaults
mpmath                    0.19                     py27_0    defaults
multipledispatch          0.4.8                    py27_0    defaults
nbconvert                 4.1.0                    py27_0    defaults
nbformat                  4.0.1                    py27_0    defaults
netcdf4                   1.2.2               np110py27_0    defaults
netCDF4                   1.2.4                     <pip>
networkx                  1.11                     py27_0    defaults
nltk                      3.2                      py27_0    defaults
nose                      1.3.7                    py27_0    defaults
notebook                  4.1.0                    py27_2    defaults
numba                     0.24.0              np110py27_0    defaults
numexpr                   2.5                 np110py27_0    defaults
numpy                     1.10.4                   py27_0    defaults
odo                       0.4.2                    py27_0    defaults
openpyxl                  2.3.2                    py27_0    defaults
openssl                   1.0.2g                    vc9_0  [vc9]  defaults
pandas                    0.18.0              np110py27_0    defaults
partd                     0.3.2                    py27_1    defaults
path.py                   8.1.2                    py27_1    defaults
patsy                     0.4.0               np110py27_0    defaults
pbr                       1.3.0                    py27_0    defaults
pep8                      1.7.0                    py27_0    defaults
pickleshare               0.5                      py27_0    defaults
pillow                    3.1.1                    py27_0    defaults
pip                       8.1.2                    py27_0    defaults
ply                       3.8                      py27_0    defaults
psutil                    4.1.0                    py27_0    defaults
py                        1.4.31                   py27_0    defaults
pyasn1                    0.1.9                    py27_0    defaults
pycosat                   0.6.1                    py27_0    defaults
pycparser                 2.14                     py27_0    defaults
pycrypto                  2.6.1                    py27_3    defaults
pyflakes                  1.1.0                    py27_0    defaults
pygments                  2.1.1                    py27_0    defaults
pyopenssl                 0.15.1                   py27_2    defaults
pyparsing                 2.0.3                    py27_0    defaults
pyproj                    1.9.5.1                  py27_0    defaults
pyqt                      4.11.4                   py27_5    defaults
pyreadline                2.1                      py27_0    defaults
pytables                  3.2.2               np110py27_2    defaults
pytest                    2.8.5                    py27_0    defaults
python                    2.7.12                        0    defaults
python-dateutil           2.5.1                    py27_0    defaults
python-hdf4               0.9                       <pip>
pytz                      2016.2                   py27_0    defaults
pywin32                   220                      py27_1    defaults
pyyaml                    3.11                     py27_3    defaults
pyzmq                     15.2.0                   py27_0    defaults
qt                        4.8.7                     vc9_7  [vc9]  defaults
qtawesome                 0.3.2                    py27_0    defaults
qtconsole                 4.2.0                    py27_1    defaults
qtpy                      1.0                      py27_0    defaults
requests                  2.9.1                    py27_0    defaults
rope                      0.9.4                    py27_1    defaults
ruamel_yaml               0.11.7                   py27_0    defaults
scikit-image              0.12.3              np110py27_0    defaults
scikit-learn              0.17.1              np110py27_0    defaults
scipy                     0.17.0              np110py27_0    defaults
biggus                    0.14.0                   py27_0    scitools
cartopy                   0.14.2              np110py27_0    scitools
cf_units                  1.1                      py27_0    scitools
expat                     2.1.0                         6    scitools
iris                      1.9.2               np110py27_0    scitools
owslib                    0.10.3                   py27_0    scitools
proj.4                    4.9.1                    py27_1    scitools
pyepsg                    0.2.0                    py27_0    scitools
pyke                      1.1.1                    py27_1    scitools
pyshp                     1.2.3                    py27_0    scitools
shapely                   1.5.13              np110py27_1    scitools
udunits2                  2.2.20                        0    scitools
setuptools                20.3                     py27_0    defaults
simplegeneric             0.8.1                    py27_0    defaults
singledispatch            3.4.0.3                  py27_0    defaults
sip                       4.16.9                   py27_2    defaults
six                       1.10.0                   py27_0    defaults
snowballstemmer           1.2.1                    py27_0    defaults
sockjs-tornado            1.0.1                    py27_0    defaults
sphinx                    1.3.5                    py27_0    defaults
sphinx_rtd_theme          0.1.9                    py27_0    defaults
spyder                    2.3.8                    py27_1    defaults
sqlalchemy                1.0.12                   py27_0    defaults
ssl_match_hostname        3.4.0.2                  py27_0    defaults
statsmodels               0.6.1               np110py27_0    defaults
sympy                     1.0                      py27_0    defaults
tk                        8.5.18                    vc9_0  [vc9]  defaults
toolz                     0.7.4                    py27_0    defaults
tornado                   4.3                      py27_0    defaults
traitlets                 4.2.1                    py27_0    defaults
unicodecsv                0.14.1                   py27_0    defaults
vs2008_runtime            9.00.30729.1                  0    defaults
vs2010_runtime            10.00.40219.1                 0    defaults
werkzeug                  0.11.4                   py27_0    defaults
wheel                     0.29.0                   py27_0    defaults
xlrd                      0.9.4                    py27_0    defaults
xlsxwriter                0.8.4                    py27_0    defaults
xlwings                   0.7.0                    py27_0    defaults
xlwt                      1.0.0                    py27_0    defaults
zlib                      1.2.8                     vc9_2  [vc9]  defaults

python-2.7 anaconda grib python-iris
person squar_o    schedule 16.08.2016    source источник
comment
Не могли бы вы поделиться своей средой conda? conda list --show-channel-urls   -  person pelson    schedule 16.08.2016
comment
Отредактировано выше, спасибо @pelson   -  person squar_o    schedule 16.08.2016

Ответы (1)


arrow_upward
3
arrow_downward

К сожалению, в настоящее время это известная проблема (в Windows) с cf_units в облаке Anaconda: см. это Проблема с conda-recipes-scitools на GitHub. Нижний комментарий к этой проблеме содержит обходной путь: обратите внимание на дополнительную строку 'Library' в пути к _alt_xml_path. На самом деле в этом вся проблема: XML-файл UDUNITS2 устанавливается в немного другое место в Windows, чем в Linux или OSX. Вы можете применить тот же обходной путь, изменив свой файл C:\Anaconda2\lib\site-packages\cf_units\__init__.py таким же образом, предполагая, что у вас есть права на запись в этот файл.

Обратите внимание, что даже в этом случае вы, к сожалению, в настоящее время не можете загружать файлы GRIB с помощью Iris в Windows. Это связано с тем, что grib_api ECMWF, лежащий в основе возможностей GRIB Iris, в настоящее время не может сам быть установлен в Windows.

Между прочим, ни одна из этих проблем не возникает в Unix-подобной системе, поэтому, если у вас есть доступ к системе Linux или OSX, могу ли я предложить вам вместо этого попробовать просмотреть файл GRIB в одной из них? Если это будет полезно, VirtualBox — это хороший и довольно простой способ запустить Linux на виртуальной машине под Windows.

person DPeterK    schedule 17.08.2016
comment
Кстати, cf_units v1.1.1 (который включает исправление пути XML) теперь доступен на ПиПИ. Вы можете установить это в свою среду conda, введя следующее в командной строке Windows: pip install cf_units --upgrade Здесь флаг --upgrade уведомляет conda о том, что вы намерены обновить существующие установленные вами cf_units. Это должно решить вашу проблему cf_units XML, по крайней мере! - person DPeterK; 17.08.2016