Ошибка openfoam openmpi: libmpi.so.0 не найден

Всякий раз, когда я пытаюсь скомпилировать решатель в openfoam, я получаю сообщение об ошибке:

/usr/bin/ld: warning: libmpi.so.0, needed by /opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)
/usr/bin/ld: warning: libopen-rte.so.0, needed by /opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)
/usr/bin/ld: warning: libopen-pal.so.0, needed by /opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Waitall'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Abort'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_double'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Get_count'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Init'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Probe'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Send'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Allreduce'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_packed'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Buffer_detach'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Bsend'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_byte'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Irecv'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Recv'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_comm_world'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Get_processor_name'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Test'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Isend'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Finalize'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `ompi_mpi_op_sum'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Buffer_attach'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Comm_size'
/opt/openfoam211/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system/libPstream.so: undefined reference to `MPI_Comm_rank'
collect2: error: ld returned 1 exit status

Я предполагаю, что проблема с установкой open-mpi. Как я могу проверить/исправить ошибку?


openmpi openfoam
person Foamer007    schedule 03.07.2015    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
2
arrow_downward

Во-первых, убедитесь, что у вас действительно установлен Open MPI.

Во-вторых, убедитесь, что OpenFOAM правильно настроен на использование Open MPI: см. соответствующие параметры в etc/bashrc (или etc/cshrc). Также убедитесь, что вы установили все необходимые переменные среды для Open MPI (у меня нет опыта работы с Open MPI, я строю с помощью Intel MPI, и есть некоторые переменные среды, которые нужно установить вручную, вызвав какой-либо скрипт).

В-третьих, проверьте командные строки ссылки, выданные wmake для сборки вашего решателя, и для сборки libPstream (во время основного процесса сборки OpenFOAM). Если строка ссылки не печатается, отредактируйте wmake/Makefile, чтобы она распечаталась. Некоторые из этих строк (я думаю, libPstream) должны содержать некоторые параметры ссылок и, скорее всего, пути, связанные с Open MPI.

person Petr    schedule 03.07.2015