Краткий ответ: кажется, что нет элегантного или простого способа сделать это, но вот обходной путь.
Я покопался в исходном коде ggpairs
(в исходном коде пакета GGally, доступном в CRAN), чтобы посмотрите, как на самом деле отрисовываются метки переменных. Соответствующей функцией в ggpairs.R
является print.ggpairs
. Оказывается, метки переменных не являются частью объектов ggplot
в каждой ячейке матрицы графика, то есть они не являются заголовками осей, поэтому на них не влияет использование theme(axis.title.x = element_text(angle = 45)
или подобного.
Скорее они выглядят как текстовые аннотации с использованием grid.text
(в пакете 'grid'
). grid.text
принимает аргументы, включая x, y, hjust, vjust, rot
(где rot
— угол поворота), а также размер шрифта, семейство шрифтов и т. д., используя gpar
(см. ?grid.text
), но похоже, что в настоящее время нет способа передать разные значения этих параметров в print.ggpairs
-- для них установлены значения по умолчанию.
Вы можете обойти это, оставив метки переменных пустыми для начала, а затем добавив их позже с настроенным размещением, поворотом и стилем, используя модификацию соответствующей части кода print.ggpairs
. Я придумал следующую модификацию. (Кстати, поскольку исходный код GGally
был выпущен под лицензией GPL-3, то и эта модификация)
customize.labels <- function(
plotObj,
varLabels = NULL, #vector of variable labels
titleLabel = NULL, #string for title
leftWidthProportion = 0.2, #if you changed these from default...
bottomHeightProportion = 0.1, #when calling print(plotObj),...
spacingProportion = 0.03, #then change them the same way here so labels will line up with plot matrix.
left.opts = NULL, #see pattern in left.opts.default
bottom.opts = NULL, #see pattern in bottom.opts.default
title.opts = NULL) { #see pattern in title.opts.default
require('grid')
vplayout <- function(x, y) {
viewport(layout.pos.row = x, layout.pos.col = y)
}
numCol <- length(plotObj$columns)
if (is.null(varLabels)) {
varLabels <- colnames(plotObj$data)
#default to using the column names of the data
} else if (length(varLabels) != numCol){
stop('Length of varLabels must be equal to the number of columns')
}
#set defaults for left margin label style
left.opts.default <- list(x=0,
y=0.5,
rot=90,
just=c('centre', 'centre'), #first gives horizontal justification, second gives vertical
gp=list(fontsize=get.gpar('fontsize')))
#set defaults for bottom margin label style
bottom.opts.default <- list(x=0,
y=0.5,
rot=0,
just=c('centre', 'centre'),#first gives horizontal justification, second gives vertical
gp=list(fontsize=get.gpar('fontsize')))
#set defaults for title text style
title.opts.default <- list(x = 0.5,
y = 1,
just = c(.5,1),
gp=list(fontsize=15))
#if opts not provided, go with defaults
if (is.null(left.opts)) {
left.opts <- left.opts.default
} else{
not.given <- names(left.opts.default)[!names(left.opts.default) %in%
names(left.opts)]
if (length(not.given)>0){
left.opts[not.given] <- left.opts.default[not.given]
}
}
if (is.null(bottom.opts)) {
bottom.opts <- bottom.opts.default
} else{
not.given <- names(bottom.opts.default)[!names(bottom.opts.default) %in%
names(bottom.opts)]
if (length(not.given)>0){
bottom.opts[not.given] <- bottom.opts.default[not.given]
}
}
if (is.null(title.opts)) {
title.opts <- title.opts.default
} else{
not.given <- names(title.opts.default)[!names(title.opts.default) %in%
names(title.opts)]
if (length(not.given)>0){
title.opts[not.given] <- title.opts.default[not.given]
}
}
showLabels <- TRUE
viewPortWidths <- c(leftWidthProportion,
1,
rep(c(spacingProportion,1),
numCol - 1))
viewPortHeights <- c(rep(c(1,
spacingProportion),
numCol - 1),
1,
bottomHeightProportion)
viewPortCount <- length(viewPortWidths)
if(!is.null(titleLabel)){
pushViewport(viewport(height = unit(1,"npc") - unit(.4,"lines")))
do.call('grid.text', c(title.opts[names(title.opts)!='gp'],
list(label=titleLabel,
gp=do.call('gpar',
title.opts[['gp']]))))
popViewport()
}
# viewport for Left Names
pushViewport(viewport(width=unit(1, "npc") - unit(2,"lines"),
height=unit(1, "npc") - unit(3, "lines")))
## new for axis spacingProportion
pushViewport(viewport(layout = grid.layout(
viewPortCount, viewPortCount,
widths = viewPortWidths, heights = viewPortHeights
)))
# Left Side
for(i in 1:numCol){
do.call('grid.text',
c(left.opts[names(left.opts)!='gp'],
list(label=varLabels[i],
vp = vplayout(as.numeric(i) * 2 - 1 ,1),
gp=do.call('gpar',
left.opts[['gp']]))))
}
popViewport()# layout
popViewport()# spacing
# viewport for Bottom Names
pushViewport(viewport(width=unit(1, "npc") - unit(3,"lines"),
height=unit(1, "npc") - unit(2, "lines")))
## new for axis spacing
pushViewport(viewport(layout = grid.layout(
viewPortCount, viewPortCount,
widths = viewPortWidths, heights = viewPortHeights)))
# Bottom Side
for(i in 1:numCol){
do.call('grid.text',
c(bottom.opts[names(bottom.opts)!='gp'],
list(label=varLabels[i],
vp = vplayout(2*numCol, 2*i),
gp=do.call('gpar',
bottom.opts[['gp']]))))
}
popViewport() #layout
popViewport() #spacing
}
А вот пример вызова этой функции:
require('data.table')
require('GGally')
require('grid')
fake.data <- data.table(test.1=rnorm(50), #make some fake data for demonstration
test.2=rnorm(50),
test.3=rnorm(50),
test.4=rnorm(50))
g <- ggpairs(data=fake.data,
columnLabels=rep('', ncol(fake.data)))
#Set columnLabels to a vector of blank column labels
#so that original variable labels will be blank.
print(g)
customize.labels(plotObj=g,
titleLabel = 'Test plot', #string for title
left.opts = list(x=-0.5, #moves farther to the left, away from vertical axis
y=0.5, #centered with respect to vertical axis
just=c('center', 'center'),
rot=90,
gp=list(col='red',
fontface='italic',
fontsize=12)),
bottom.opts = list(x=0.5,
y=0,
rot=45, #angle the text at 45 degrees
just=c('center', 'top'),
gp=list(col='red',
fontface='bold',
fontsize=10)),
title.opts = list(gp=list(col='green',
fontface='bold.italic'))
)
(Это делает некоторые очень уродливые ярлыки - только для демонстрации!)
Я не возился с размещением меток где-то еще, кроме левого и нижнего, как в вашем примере с Geovisualist, но я думаю, вы бы сделали это, изменив аргументы на vplayout
в «Левой стороне» и «Нижней стороне». куски кода в customize.labels
. Координаты x
и y
в grid.text
определяются относительно области просмотра, которая делит область отображения на сетку в
pushViewport(viewport(layout = grid.layout(
viewPortCount, viewPortCount,
widths = viewPortWidths, heights = viewPortHeights
)))
Вызов vplayout
указывает, какая ячейка сетки используется для размещения каждой метки.
person
Caroline Ring
schedule
26.03.2015