У меня есть матрица со следующими именами строк:
"X1" "X5" "X33" "X37" "X52" "X566"
Теперь я хочу выбрать только те строки, которые соответствуют записям списка, скажем:
include_list <- c("X1", "X5", "X33")
Я думаю, я бы сделал что-то вроде этого:
data.subset <- subset(data, row.names == include_list)
Однако этот конкретный код, похоже, не выполняет эту работу. Как я могу выполнить подмножество таким образом?
Настройте некоторые поддельные данные:
m <- matrix(1:30, 6, 5)
rownames(m) <- c("X1", "X5", "X33", "X37", "X52", "X566")
m
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# X1 1 7 13 19 25
# X5 2 8 14 20 26
# X33 3 9 15 21 27
# X37 4 10 16 22 28
# X52 5 11 17 23 29
# X566 6 12 18 24 30
Здесь, вероятно, проще всего выполнить подмножество с индексацией матрицы ([):
include_list <- c("X1", "X5", "X33")
m[include_list, ]
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# X1 1 7 13 19 25
# X5 2 8 14 20 26
# X33 3 9 15 21 27
Альтернатива с функцией subset():
subset(m, rownames(m) %in% include_list)
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# X1 1 7 13 19 25
# X5 2 8 14 20 26
# X33 3 9 15 21 27
Это также, кажется, работает:
include_list <- head(read.csv("/Users/histelheim/include_list.csv", header = FALSE))
include_list <- c(do.call("cbind", include_list))
data[row.names(data) %in% include_list, ]
На всякий случай, если чей-то include_list является классом list (а не вектором), то это модификация ответа Рича Скривена, которая работает в таком случае на основе это. unlist() следует добавить:
m <- matrix(1:30, 6, 5)
rownames(m) <- c("X1", "X5", "X33", "X37", "X52", "X566")
include_list <- list("X1", "X5", "X33")
m[unlist(include_list), ]
