Установите Scipy с MKL через PIP

Intel публикует такие пакеты, как Numpy, Scipy и Scikit-learn для PyPI. Эти колеса были созданы при компоновке с Intel MKL и включают в себя различные оптимизации.

Если вы хотите, чтобы Scipy был построен с помощью Intel MKL:

#Remove existing Numpy and/or Scipy:
pip uninstall numpy scipy -y
#Install scipy built with Intel MKL:
pip install intel-scipy

Дополнительная информация доступна здесь

У меня 64-разрядная версия Win10 с Python 3.6.2. Я установил scipy через http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy

Я выполнил следующие шаги:

• Шаг 1: Удалите, если у вас есть какая-либо предыдущая версия numpy, pip удалите numpy
• Шаг 2: Загрузите numpy‑1.13.1+mkl‑cp36‑cp36m‑win_amd64.whl с MKL (библиотека математического ядра) по ссылке ниже, http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#numpy
• Шаг 3: скопируйте загруженный файл в другое место и запустите командную строку из этого места.
• Шаг 4: запустите эту команду, pip install -U numpy-1.13.1+mkl-cp36-cp36m-win_amd64.whl
• Шаг 5: Теперь загрузите библиотеку scipy с http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy
• Шаг 6: Скопируйте загруженный файл в то же место, куда скопирован numpy.
• Шаг 7: В командной строке CMD запустите этот cmd, pip install scipy-0.19.1-cp36-cp36m-win_amd64.whl

Сделанный!

Прошло 2 года с тех пор, как был задан этот вопрос.

Теперь есть колеса numpy/scipy для Linux, которые используют openblas, скомпилированный для avx2, поэтому вы можете получить гораздо лучшую производительность без сборки пакетов. Возможно, вам потребуется обновить pip, чтобы установить колесо:

pip install --upgrade pip
pip install numpy scipy

Если вам нужен MKL, вы можете установить Anaconda или Распространение Intel для Python. Они используют conda вместо pip для управления пакетами, но они бесплатны и распространяют пакеты, содержащие все зависимости, включая MKL.

Если у вас возникли проблемы с установкой или запуском определенной версии, сначала удалите, а затем установите

Шаг 1:

pip uninstall -v numpy

Шаг 2: скачайте файл колеса и установите

pip install -U numpy-1.13.0+mkl-cp36-cp36m-win_amd64.whl

В этом примере имя файла колеса "numpy-1.13.0+mkl-cp36-cp36m-win_amd64.whl"

В последние несколько недель я столкнулся с этой проблемой: Windows 10 64-бит Python 3.5.2

Мой обходной путь:

Первый: pip install wheel

Далее: Загрузите Numpy и Scipy из репозитория Gholke Numpy и SciPy

Потом:

pip install numpy_package.whl

pip install scipy_package.whl

Поскольку на сам вопрос не было ответа, позвольте мне попробовать...

Я думаю, что проблема здесь в основном заключается в том, что используемые библиотеки BLAS/LAPACK разбросаны по нескольким местам, и numpy плохо справляется с этим.

Мы исправили это в EasyBuild, где уже некоторое время собираем numpy/scipy поверх Intel MKL, с помощью этого исправления: https://github.com/hpcugent/easybuild-easyconfigs/blob/master/easybuild/easyconfigs/n/numpy/numpy-1.8.1-mkl.patch

Для меня MKL поставляется с библиотекой Scipy от conda install scipy

Решение @rscohn2 дало мне подсказку по использованию пакетов.

Для справки, моя среда включает Ubuntu, Anaconda, Python 3.6, Scipy 1.1 и MKL 2018.0.