Работает ли анимация imshow с qt-backend? Следующее отлично работает в не-qt, но не анимируется с использованием qt - просто показывает последний кадр:
img = standard_normal((40,40))
image =imshow(img,interpolation='nearest',animated=True)
for k in range(1,10):
img = standard_normal((40,40))
image.set_data(img)
draw()