Кодировать cp-1252 как utf-8?

Если проблема заключается не только в именах файлов, но и в содержимом, самый простой способ решить проблему — установить locale на компьютере с Linux на что-то, основанное на ISO-8859-1, а не на UTF-8. Вы можете использовать locale -a для отображения списка доступных локалей. Например, если у вас есть en_US.iso88591, вы можете использовать:

export LANG=en_US.iso88591

Таким образом, Java будет использовать ISO-8859-1 для имен файлов, что, вероятно, достаточно хорошо. Чтобы запустить программу Java, вам все равно нужно установить системное свойство file.encoding:

java -Dfile.encoding=cp1252 -cp foo.jar:bar.jar blablabla

Если локаль ISO-8859-1 недоступна, вы можете создать ее с помощью localedef. Однако для его установки требуется root-доступ. На самом деле вы можете сгенерировать локаль, использующую CP-1252, если она доступна в вашей системе. Например:

sudo localedef -f CP1252 -i en_US en_US.cp1252
export LANG=en_US.cp1252

Таким образом, Java должна использовать CP1252 по умолчанию для всех операций ввода-вывода, включая имена файлов.

Более подробно здесь: http://jonisalonen.com/2012/java-and-file-names-with-invalid-characters/

Вы можете читать и записывать текстовые данные в любой кодировке, которую пожелаете. Вот пример быстрого кода:

  public static void main(String[] args) throws Exception
  {
    // List all supported encodings
    for (String cs : Charset.availableCharsets().keySet())
      System.out.println(cs);

    File file = new File("SomeWindowsFile.txt");
    StringBuilder builder = new StringBuilder();

    // Construct a reader for a specific encoding
    Reader reader = new InputStreamReader(new FileInputStream(file), "windows-1252");
    while (reader.ready())
    {
      builder.append(reader.read());
    }
    reader.close();

    String string = builder.toString();

    // Construct a writer for a specific encoding
    Writer writer = new OutputStreamWriter(new FileOutputStream(file), "UTF8");
    writer.write(string);
    writer.flush();
    writer.close();
  }

Если это все еще «задыхается» при чтении, посмотрите, можете ли вы проверить, что исходная кодировка — это то, что вы думаете. В этом случае я указал windows-1252, который является строкой java для cp-1252.