У меня есть div с примененным к нему преобразованием CSS rotateX:
-webkit-transform: perspective(500px) rotateX(60deg) rotateY(60deg) ;
и в нем плавала куча меньших div с примененным к ним правилом :hover. Проблема в том, что только половина внутренних div реагируют на событие :hover.
JsFiddle: http://jsfiddle.net/fNxgn/4/