Критическая оценка предсказания структуры белка
CASP - это всемирный эксперимент по предсказанию структуры белков. Это сообщество было создано в 1994 году и предоставляет средства объективного тестирования этих методов посредством процесса слепого прогнозирования, предоставляет исследовательским группам возможность протестировать методы прогнозирования структуры белка и дает независимую оценку состояния дел в области моделирования структуры белка. исследовательскому сообществу и пользователям программного обеспечения.
Эксперименты CASP сосредоточены на создании текущих прогнозов структуры, выявлении достигнутого прогресса, а также выявлении того, на чем следует сосредоточить будущие прогнозы или методы, чтобы они были более продуктивными.
CASP можно в чем-то сравнить с соревнованием Kaggle: участники представляют свои модели для прогнозов структуры белка, и они оцениваются и тестируются. Было проведено тринадцать предыдущих экспериментов с CASP. В этих экспериментах учитываются цели, прогнозы, интерактивные таблицы с результатами числовой оценки, динамические графики и инструменты визуализации прогнозов.
В декабре 2018 года CASP13 попал в заголовки газет, когда его выиграла AlphaFold, программа искусственного интеллекта, созданная DeepMind.
В задачи Центра входили: распространение информации об эксперименте CASP; регистрация участников; оказание помощи в подключении зарегистрированных серверов, запросе, проверке, выборе, предварительной обработке и выпуске целей для прогнозирования во всем диапазоне категорий моделирования; принятие представленных прогнозов и - работа с оргкомитетом CASP - планирование конференции CASP и публикация материалов встречи.
Все прогнозы CASP и результаты численной оценки доступны на их веб-сайте после встречи и публикуются в научном журнале. Текущий конкурс CASP, который стартовал в марте 2020 года, результаты будут опубликованы 4 декабря 2020 года. Если вы хотите проверить его результаты, посетите веб-сайт CASP’S.
