MappedSuperclass — изменить SequenceGenerator в подклассе

Да, это возможно. Вы можете переопределить имя генератора по умолчанию с помощью аннотации @SequenceGenerator.

• Базовый класс

    @MappedSuperclass
    public abstract class PersistentEntity implements Serializable
    {
        private static final long serialVersionUID = 1L;

        @Id
        @GeneratedValue(strategy = GenerationType.SEQUENCE, generator = "default_gen")
        protected Long id = 0L;

        public Long getId()
        {
            return id;
        }

        public void setId(Long id)
        { 
            this.id = id;
        }
    }

• Последовательность (SQL)

  create sequence role_seq;

• Производный класс

    @Entity
    @Table(name = "role")
    @SequenceGenerator(name = "default_gen", sequenceName = "role_seq", allocationSize = 1)
    public class Role extends PersistentEntity implements Serializable
    {
        private static final long serialVersionUID = 1L;

        @NotNull
        @Size(max = 32)
        private String name;

        public String getName()
        {
             return name;
        }

        public void setName(String name)
        {
             this.name = name;
        }   
    }

• Этот подход отлично работал в Hibernate 4.1.x, но не в EclipseLink 2.x.

изменить

• Судя по комментарию, он работает с EclipseLink 2.6.1-RC1.

В JPA это невозможно сделать с помощью аннотаций. Сама аннотация не может быть переопределена. Entity наследует всю информацию о сопоставлении от MappedSuperClass. Есть только две аннотации, которые можно использовать для переопределения сопоставлений, унаследованных от сопоставленного суперкласса:

1. AttributeOverride для переопределения сопоставлений столбцов и
2. AssociationOverride для переопределения столбцов/таблиц объединения.

Ни один из них не помогает с GeneratedValue.

С EclipseLink вы можете использовать файл Customizer. DescriptorCustomizer определяет способ настройки всей информации об дескрипторе jpa (также известном как постоянный объект).

public class SequenceCustomizer implements DescriptorCustomizer {

    @Override
    public void customize(ClassDescriptor descriptor) throws Exception {
        descriptor.setSequenceNumberName(descriptor.getTableName());
    }
}

и в вашем сопоставленном суперклассе:

@MappedSuperclass
@Customizer(SequenceCustomizer.class)
public abstract class AbstractEntity implements Serializable {
    ...
}

Я пишу это, так как это становится слишком нечитаемым, как комментарий к принятому ответу:

У меня есть BaseEntity, от которого наследуется любая другая сущность:

Базеентити.java:

@MappedSuperclass
public abstract class BaseEntity {

    @Id
    @GeneratedValue(strategy = GenerationType.SEQUENCE, generator = "SEQ_ID")
    private Long id;

Затем у меня есть две сущности User и Order, которые обе наследуются от BaseEntity, а также имеют аннотацию @SequenceGenerator:

Пользователь.java:

@SequenceGenerator(name = "SEQ_ID", sequenceName = "SEQ_USER", allocationSize = 1)
public class User extends BaseEntity { ... }

Заказ.java:

@SequenceGenerator(name = "SEQ_ID", sequenceName = "SEQ_ORDER", allocationSize = 1)
public class Order extends BaseEntity { ... }

Он работает на H2 по крайней мере с 2 последовательностями SEQ_USER и SEQ_ORDERS:

select SEQ_USER.nextval from dual;
select SEQ_ORDERS.nextval from dual;