Выражение переменной %Var% не работает в цикле for в пакетном файле

Вам нужно поместить команду в ` ` вот так

FOR /F "tokens=* USEBACKQ" %F IN (`java -jar %MAVEN_HOME%\jenkins-cli.jar -s http://someip.com build /dev/ -s  --username **** --password ***`) DO (SET var=%F)

потому что синтаксис

C:\>for /?
Runs a specified command for each file in a set of files.

FOR %variable IN (set) DO command [command-parameters]

  %variable  Specifies a single letter replaceable parameter.
  (set)      Specifies a set of one or more files.  Wildcards may be used.
  command    Specifies the command to carry out for each file.
  command-parameters
             Specifies parameters or switches for the specified command.

To use the FOR command in a batch program, specify %%variable instead
of %variable.  Variable names are case sensitive, so %i is different
from %I.

...

FOR /F ["options"] %variable IN (file-set) DO command [command-parameters]
FOR /F ["options"] %variable IN ("string") DO command [command-parameters]
FOR /F ["options"] %variable IN ('command') DO command [command-parameters]

    or, if usebackq option present:

FOR /F ["options"] %variable IN (file-set) DO command [command-parameters]
FOR /F ["options"] %variable IN ('string') DO command [command-parameters]
FOR /F ["options"] %variable IN (`command`) DO command [command-parameters]

Как видите, у вас есть USEBACKQ, поэтому команда должна быть окружена обратными кавычками, а также сказано, что вам нужно удвоить процент, если вы хотите использовать команду for в пакетном файле.