Слишком длинная строка E501 в стиле Pycode (118 > 79 символов)

Длинные строки не обязательно плохи, если они не влияют на удобочитаемость. Это дело вкуса. Вы можете отключить предупреждение, добавив # noqa, либо разбить строку на несколько:

Например. используя скобки:

charr_prob = (float(self.char_freq(kgram, char) * 1.0 
              / (self.kgram_freq(kgram) * 1.0)))

Поскольку float уже использует круглые скобки:

charr_prob = float(self.char_freq(kgram, char) * 1.0
             / (self.kgram_freq(kgram) * 1.0))

Вы также можете использовать \ в конце первой строки, чтобы включить вторую строку в текущее выражение. Здесь это будет избыточно со скобками, определенными для float, но если вы удалите вызов float, это будет:

charr_prob = (self.char_freq(kgram, char) * 1.0) \
             / (self.kgram_freq(kgram) * 1.0)

Вы также можете упростить выражение, когда это возможно. Предполагая, что вы используете Python3 (и, следовательно, / не является целочисленным делением):

charr_prob = self.char_freq(kgram, char) / self.kgram_freq(kgram)

Или для Python2 (79 символов!):

charr_prob = float(self.char_freq(kgram, char)) / float(self.kgram_freq(kgram))

Или, как предложил @Blender, даже:

charr_prob = float(self.char_freq(kgram, char)) / self.kgram_freq(kgram)

... второй float не нужен, поскольку первый операнд / уже является числом с плавающей запятой. Другая возможность — импортировать поведение / из Python3 в Python2:

from __future__ import division