Кто-нибудь знает, как извлечь репрезентативные последовательности из вывода seqrep в формате SPS? Это было бы очень полезно для зрителей сюжета из seqrplot.
Формат SPS репрезентативной последовательности из seqrep
Ответы (1)
Вы можете распечатать вывод с аргументом format = 'SPS'
. Я иллюстрирую biofam
данными
data(biofam)
biofam.lab <- c("Parent", "Left", "Married", "Left+Marr",
"Child", "Left+Child", "Left+Marr+Child", "Divorced")
biofam.seq <- seqdef(biofam, 10:25, labels=biofam.lab)
## Computing the distance matrix
costs <- seqcost(biofam.seq, method="INDELSLOG")
biofam.om <- seqdist(biofam.seq, method="OM", sm=costs$sm, indel=costs$indel)
## Representative set using the neighborhood density criterion
biofam.rep <- seqrep(biofam.seq, diss=biofam.om, criterion="density")
print(biofam.rep, format="SPS")
## Sequence
## [1] (0,16)
## [2] (0,9)-(3,1)-(6,6)
## [3] (0,6)-(1,10)
И если вы хотите получить репрезентативные последовательности в форме SPS, вы можете использовать seqformat
и seqconc
:
biofam.rep.sps <- seqconc(seqformat(biofam.rep, to='SPS'))
Результатом является матрица с одним столбцом, в которой каждая репрезентативная последовательность хранится в виде строки символов.
person
Gilbert
schedule
13.03.2018
Можно ли иметь представителя по кластеру, используя группу = фактор кластера?
- person Yolande; 14.03.2018
Это другой вопрос, и вам лучше всего создать для него отдельную ветку. Но вы можете получить представителей по кластеру, используя функцию
seqrep.grp
для TraMineRextras
.
- person Gilbert; 14.03.2018
@ Гилберт. Благодарю вас!
- person Yolande; 15.03.2018