Установка пакетов в IRkernel на Jupyter Notebook

Для справки, я прочитал следующие темы и статьи:

Однако, если я использую типичный подход R:

.libPaths()
# '/home/ytu/anaconda3/lib/R/library'
install.packages("RPostgreSQL", lib = .libPaths(), repo = "https://cloud.r-project.org/")

Это дает мне:

Предупреждающее сообщение в install.packages("RPostgreSQL", lib = .libPaths(), repo = "https://cloud.r-project.org/"): "установка пакета "RPostgreSQL" имела ненулевой статус выхода" Обновление HTML-индекса пакетов в ".Library" Создание "packages.html" ... готово

Я некоторое время гуглил, но не могу решить эту проблему. Я указал и путь к библиотеке, и ссылку на зеркало CRAN, но у меня это все равно не работает.

Если я следую инструкциям подхода conda с веб-страницы, Tracebacks просто очищает мой терминал на шаге conda build r-rpostgresql:

Трассировка (последний последний вызов): файл «/home/ytu/anaconda3/bin/conda-build», строка 11, в sys.exit(main()) File «/home/ytu/anaconda3/lib/python3.6 /site-packages/conda_build/cli/main_build.py", строка 413, в основном файле execute(sys.argv[1:]) "/home/ytu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/conda_build/ cli/main_build.py", строка 404, в файле execute verify=args.verify) Файл "/home/ytu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/conda_build/api.py", строка 193, в сборке need_source_download =need_source_download, config=config, варианты=варианты) Файл "/home/ytu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/conda_build/build.py", строка 1944, в build_tree note=notest, файл "/home /ytu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/conda_build/build.py", строка 1240, в сборке utils.check_call_env(cmd, env=env, cwd=src_dir) Файл "/home/ytu/anaconda3/ lib/python3.6/site-packages/conda_build/utils.py", строка 678, в check_call_env возвращает _func_defaulting_env_to _os_environ(subprocess.check_call, *popenargs, **kwargs) Файл "/home/ytu/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/conda_build/utils.py", строка 674, в _func_defaulting_env_to_os_environ return func(_args, * *kwargs) Файл "/home/ytu/anaconda3/lib/python3.6/subprocess.py", строка 291, в check_call поднять CalledProcessError(retcode, cmd) subprocess.CalledProcessError: Command '['/bin/bash', ' -e', '/home/ytu/anaconda3/conda-bld/r-rpostgresql_1519543361442/work/conda_build.sh']' вернул ненулевой статус выхода 1.

Может ли кто-нибудь дать мне несколько предложений?

Информация об ОС от uname -mrs:

Linux 3.13.0-105-общий x86_64


person ytu    schedule 06.02.2018    source источник
comment
Отправлен комментарий к проблеме Conda Недавние изменения conda, нарушающие Travis #6030.   -  person ytu    schedule 25.02.2018
comment
Влияет ли это на какой-либо пакет R или что-то особенное в RPostgresql? Попробуйте установить какой-нибудь действительно простой пакет, чтобы проверить, работает ли он.   -  person Thomas K    schedule 02.03.2018
comment
@ThomasK все пакеты R потерпят неудачу. Я пробовал такие пакеты, как r-lme4, но он показал ту же ошибку в conda build r-lme4. Я могу установить пакеты R только из встроенных, которые уже находятся на канале conda R, но я не могу собрать свои собственные.   -  person ytu    schedule 03.03.2018