Изменение названий осей для автографика

Использование autoplot из ggfortify для создания диагностических графиков:

library(ggplot2)
library(ggfortify)

mod <- lm(Petal.Width ~ Petal.Length, data = iris)
autoplot(mod, label.size = 3)

Можно ли изменить оси и названия графиков (легко)? Я хотел бы их перевести.

введите описание изображения здесь


person erc    schedule 07.07.2017    source источник


Ответы (3)


Функция autoplot.lm возвращает объект S4 (класс ggmultiplot, см. ?`ggmultiplot-class`). Если вы посмотрите на файл справки, вы увидите, что у них есть методы замены для отдельных графиков. Это означает, что вы можете извлечь отдельный график, изменить его и вернуть обратно. Например:

library(ggplot2)
library(ggfortify)

mod <- lm(Petal.Width ~ Petal.Length, data = iris)
g <- autoplot(mod, label.size = 3) # store the ggmultiplot object

# new x and y labels
xLabs <- yLabs <- c("a", "b", "c", "d")

# loop over all plots and modify each individually
for (i in 1:4)
    g[i] <- g[i] + xlab(xLabs[i]) + ylab(yLabs[i])

# display the new plot
print(g) 

Здесь я только изменил метки осей, но вы меняете что-либо в графиках по отдельности (темы, цвета, заголовки, размеры).

person Vandenman    schedule 25.07.2017

Решения, предложенные @user20650, интересны и элегантны.

Вот менее элегантное решение, основанное на myautoplot, модифицированной версии autoplot. Надеюсь, это поможет вам.
Загрузите функцию myautoplot здесь и сохраните ее в своем рабочем каталоге с именем myautoplot.r.
Затем используйте следующий код:

library(ggplot2)
library(ggfortify)

source("myautoplot.r")
mod <- lm(Petal.Width ~ Petal.Length, data = iris)

####
# Define x-labels, y-labels and titles
####
# Residuals vs Fitted Plot
xlab_resfit <- "Xlab ResFit"
ylab_resfit <- "Ylab ResFit"
title_resfit <- "Title ResFit"

# Normal Q-Q Plot
xlab_qqplot <- "Xlab QQ"
ylab_qqplot <- "Ylab QQ"
title_qqplot <- "Title QQ"

# Scale-Location Plot
xlab_scaleloc <- "Xlab S-L"
ylab_scaleloc <- "Ylab S-L"
title_scaleloc <- "Title S-L"

# Cook's distance Plot
xlab_cook <- "Xlab Cook"
ylab_cook <- "Ylab Cook"
title_cook <- "Title Cook"

# Residuals vs Leverage Plot
xlab_reslev <- "Xlab Res-Lev"
ylab_reslev <- "Ylab Res-Lev"
title_reslev <- "Title Res-Lev"

# Cook's dist vs Leverage Plot
xlab_cooklev <- "Xlab Cook-Lev"
ylab_cooklev <- "Ylab Cook-Lev"
title_cooklev <- "Title Cook-Lev"

# Collect axis labels and titles in 3 lists    
xlab_list <- list(resfit=xlab_resfit, qqplot=xlab_qqplot, 
      scaleloc=xlab_scaleloc, cook=xlab_cook, reslev=xlab_reslev,
      cooklev=xlab_cooklev)
ylab_list <- list(resfit=ylab_resfit, qqplot=ylab_qqplot, 
      scaleloc=ylab_scaleloc, cook=ylab_cook, reslev=ylab_reslev,
      cooklev=ylab_cooklev)
title_list <- list(resfit=title_resfit, qqplot=title_qqplot, 
      scaleloc=title_scaleloc, cook=title_cook, reslev=title_reslev,
      cooklev=title_cooklev)

# Pass the lists of axis labels and title to myautoplot
myautoplot(mod, which=1:6, xlab=xlab_list, 
                           ylab=ylab_list, 
                           title=title_list)

введите описание изображения здесь

person Marco Sandri    schedule 24.07.2017

library(ggplot2)
library(ggfortify)

mod <- lm(Petal.Width ~ Petal.Length, data = iris)
autoplot(mod,which=c(1:6), ncols=2)    #total 6 plots in two columns
#change axes label & title of plot 1. similarly by changing 'which' parameters count you can label other plots.
autoplot(mod,which=1) + 
  labs(x="x-axis label of fig1", y="y-axis label of fig1", title="Fig1 plot")

Пожалуйста, не забудьте сообщить нам, помогло ли это :)

person 1.618    schedule 07.07.2017
comment
Это хорошо работает для одного сюжета, но поскольку каждый сюжет нужно создавать отдельно, как их объединить? ни grid.arrange, ни cowplot не работают с plot_grid из-за класса объекта autoplot. - person erc; 24.07.2017
comment
@свекла ; вы можете прокручивать цифры, настраивая метки. m <- mapply(function(w, x, y, z) autoplot(mod, which=w) + labs(x=x, y=y, title=z), w=1:6, x=paste0("x", 1:6), y=paste0("y", 1:6), z=paste0("tit", 1:6)). Вероятно, есть более простой способ объединить их, но этот, кажется, работает: l <- do.call(c, lapply(m, function(x) x@plots)) ; gridExtra::grid.arrange(grobs=l, ncol=2) - person user20650; 24.07.2017
comment
кажется, вы также можете сделать p[1,1] <- p[1,1] + labs(x="x-axis label of fig1", y="y-axis label of fig1", title="Fig1 plot"), что может дать другой маршрут (p - это исходный автограф) - person user20650; 24.07.2017