Конфигурация MySQL для FUSEKI

Мне нужно протестировать конкретное решение для базы данных в сравнении со старым, которое использовало fuseki+mysql в качестве тройного хранилища. В основном все, что мне нужно сделать, это сделать запрос к базе данных, которую я ранее создал, с помощью SPARQL. Проблема в том, что я не могу настроить fuseki, чтобы получить конечную точку этой базы данных. Я создал базу данных с обычным стандартным кодированием Java (JDBC без использования компонента Jena SDB). Версия mysql, которую я использую:

mysql  Ver 14.14 Distrib 5.5.37, for debian-linux-gnu (x86_64) using readline 6.3

По сути, у меня есть исключение ClassNotFoundException, которое я не могу решить. Здесь подробности исключения:

    com.hp.hpl.jena.shared.JenaException: java.lang.ClassNotFoundException: net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadClassNamedBy(AssemblerHelp.java:145)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadArbitraryClass(AssemblerHelp.java:129)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadArbitraryClasses(AssemblerHelp.java:93)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerGroup$ExpandingAssemblerGroup.loadClasses(AssemblerGroup.java:86)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerGroup$ExpandingAssemblerGroup.open(AssemblerGroup.java:79)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerBase.open(AssemblerBase.java:52)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.assemblers.AssemblerBase.open(AssemblerBase.java:48)
    at org.apache.jena.fuseki.server.FusekiConfig.processService(FusekiConfig.java:241)
    at org.apache.jena.fuseki.server.FusekiConfig.configure(FusekiConfig.java:149)
    at org.apache.jena.fuseki.FusekiCmd.exec(FusekiCmd.java:364)
    at arq.cmdline.CmdMain.mainMethod(CmdMain.java:97)
    at arq.cmdline.CmdMain.mainRun(CmdMain.java:59)
    at arq.cmdline.CmdMain.mainRun(CmdMain.java:46)
    at org.apache.jena.fuseki.FusekiCmd.main(FusekiCmd.java:101)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:366)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)
    at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
    at java.lang.Class.forName0(Native Method)
    at java.lang.Class.forName(Class.java:190)
    at com.hp.hpl.jena.assembler.AssemblerHelp.loadClassNamedBy(AssemblerHelp.java:144)
    ... 13 more

Вызов fuseki добавляет необходимые библиотеки в путь к классам (я сохранил их в каталоге lib внутри основного каталога fuseki):

java -cp lib/arq-2.8.8.jar:lib/arq-2.8.9-SNAPSHOT.jar:lib/jena-iri-0.9.0-incubating.jar:lib/mysql-connector-java-5.1.19.jar:lib/ReconnectingSDB-0.1-SNAPSHOT.jar:lib/sdb-1.3.4.jar -jar fuseki-server.jar --config=fuseki-mysql.ttl

Мой файл конфигурации:

    # Licensed under the terms of http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0

@prefix :        <#> .
@prefix fuseki:  <http://jena.apache.org/fuseki#> .
@prefix rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix rdfs:    <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix tdb:     <http://jena.hpl.hp.com/2008/tdb#> .
@prefix ja:      <http://jena.hpl.hp.com/2005/11/Assembler#> .
@prefix jumble:  <http://rootdev.net/vocab/jumble#> .
@prefix sdb:     <http://jena.hpl.hp.com/2007/sdb#> .

[] rdf:type fuseki:Server ;
   # Timeout - server-wide default: milliseconds.
   # Format 1: "1000" -- 1 second timeout
   # Format 2: "10000,60000" -- 10s timeout to first result, then 60s timeout to for rest of query.
   # See java doc for ARQ.queryTimeout
   ja:context [ ja:cxtName "arq:queryTimeout" ;  ja:cxtValue "10000,60000" ] ;

   fuseki:services (
     <#service_MySQL_read_only>
   ) .

# SDB
[] ja:loadClass "net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect" .
jumble:SDBConnect rdfs:subClassOf ja:RDFDataset .

<#service_MySQL_read_only> rdf:type fuseki:Service ;
    rdfs:label                      "UF MySQL Service (R)" ;
    fuseki:name                     "MySQL" ;
    fuseki:serviceQuery             "query" ;
    fuseki:serviceQuery             "sparql" ;
    fuseki:serviceUpdate            "update" ;
    fuseki:serviceUpload            "upload" ;
    fuseki:serviceReadWriteGraphStore      "data" ;
    # A separate read-only graph store endpoint:
    fuseki:serviceReadGraphStore       "get" ;
    fuseki:dataset           <#ufmysql_dataset_read> ;
    #fuseki:dataset           <#MySQLStore> ;
        .
<#ufmysql_dataset_read> rdf:type      sdb:DatasetStore ;
    sdb:store <#MySQLStore>
    .
<#MySQLStore> rdf:type jumble:SDBConnect;
    rdfs:label                  "UF MySQL SDB Store";
    sdb:layout                  "layout2";
    sdb:connection
    [ rdf:type sdb:SDBConnection;
        sdb:sdbHost "localhost";
        sdb:sdbType "MySQL";
        sdb:sdbName "EA_db_test";
        sdb:sdbUser "*****";
        sdb:sdbPassword "*****";
        sdb:driver "com.mysql.jdbc.Driver";
    ]
        .

Если я поставлю вместо ja:loadClass "net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect" (который, как мне кажется, немного устарел) ja:loadClass "com.hp.hpl.jena.sdb.SDB", я получу то же исключение но с классом SDB

com.hp.hpl.jena.shared.JenaException: java.lang.ClassNotFoundException: com.hp.hpl.jena.sdb.SDB

Список jar, который у меня есть в папке lib в fuseki:

2247124 mag 12  2012 arq-2.8.8.jar
2259436 mag 12  2012 arq-2.8.9-SNAPSHOT.jar
154157 mag 12  2012 jena-iri-0.9.0-incubating.jar
801912 mag 12  2012 mysql-connector-java-5.1.19.jar
6657 mag 12  2012 ReconnectingSDB-0.1-SNAPSHOT.jar
529092 mag 12  2012 sdb-1.3.4.jar

Моя версия ФУСЕКИ:

Jena:       VERSION: 2.7.1-incubating-SNAPSHOT
Jena:       BUILD_DATE: 20120426-0201
ARQ:        VERSION: 2.9.1-incubating-SNAPSHOT
ARQ:        BUILD_DATE: 20120430-1956
TDB:        VERSION: 0.9.1-incubating-SNAPSHOT
TDB:        BUILD_DATE: 20120430-2052
Fuseki:     VERSION: 0.2.2-incubating-SNAPSHOT
Fuseki:     BUILD_DATE: 20120501-1232

Есть ли какая-то конкретная комбинация версии jar, которую я должен использовать? Любой указатель на то, где я могу найти пропавшую банку (если чего-то не хватает или мне нужна другая версия). Или я просто ошибся с файлом конфигурации, и я должен использовать что-то другое?

Спасибо за помощь


person Ancelot182    schedule 29.06.2014    source источник


Ответы (2)


  1. Не смешивайте версии jar-файлов Jena — используйте набор jar-файлов из одного дистрибутива.
  2. -cp и -jar не работают вместе - параметр пути к классам будет проигнорирован.

из-за (2) net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect не исходит из банки.

person AndyS    schedule 29.06.2014
comment
Я использовал переменную для компиляции, и теперь она работает, сервер работает. У меня все еще есть некоторые проблемы с пониманием того, как запрашивать правильную базу данных, поскольку простой запрос, подобный этому, вызывает шину PREFIX исключения 500: ‹neo4j.org#BusinessProcess› SELECT ?app WHERE {bus:2 ?rel ?app } Я думаю, это потому, что он выполняет выборку в странной таблице, возможно, мне нужно определить клаузулу FROM. Однако спасибо за ответ о пути к классам. - person Ancelot182; 29.06.2014
comment
Это не отвечает на вопрос. Откуда берется net.rootdev.fusekisdbconnect.SDBConnect? Это часть какой-то версии дистрибутива jena? дистрибутив фузеки? в другом месте? - person Nicolas Rouquette; 03.07.2019
comment
Это не часть Apache Jena. - person AndyS; 04.07.2019

похоже, что это чистая проблема пути к классам, не имеющая ничего общего с любыми другими вашими вещами. Я нашел отличную ссылку на пути к классам. Главное там:

Также стоит отметить, что когда вы используете параметр командной строки java -jar для запуска вашей Java-программы как исполняемого файла JAR, переменная среды CLASSPATH будет игнорироваться, а также -cp и Переключатели -classpath будут игнорироваться. В этом случае вы можете указать путь к классам Java в файле META-INF/MANIFEST.MF, используя атрибут Class-Path. Короче говоря, атрибут пути к классу в файле манифеста переопределяет путь к классу, указанный переменной среды -cp, -classpath или CLASSPATH.

Надеюсь это поможет.

person JMelnik    schedule 29.06.2014