starcluster easy_install windows

Я пытаюсь настроить кластер R на AWS, используя StarCluster и более поздний AMI BioCoductor. Цель состоит в том, чтобы запустить некоторые параллельные вычисления на нескольких узлах с использованием снега.

Однако я уже в начале застрял в установке StarCluster на WINDOWS 7 64bit (вероятно, причина).

Что я сделал: (http://star.mit.edu/cluster/docs/latest/installation.html)

  1. Установите Python 2.7.5
  2. добавил каталог c:\Pyhton\Scripts в PATH (и даже перезапустил)
  3. установленный setuptools 0.6rc11
  4. крипто 2.3
  5. открыл приглашение CMD в c:\Python\Scripts и выполнил: easy_install StarCluster

Однако это заканчивается ошибкой. Похоже, он использует не те папки

У кого-нибудь есть идея?

C:\Python27\Scripts>easy_install StarCluster
Searching for StarCluster
Reading http://pypi.python.org/simple/StarCluster/
Best match: StarCluster 0.94
Downloading pypi.python.org/packages/source/S/StarCluster/StarCluster-
0.94.tar.gz#md5=982f59fde2a32b4bc059a497f5c0a0b7
Processing StarCluster-0.94.tar.gz
Running StarCluster-0.94\setup.py -q bdist_egg --dist-dir 
c:\users\floris\appdata\local\temp\easy_in
stall-6bfhto\StarCluster-0.94\egg-dist-tmp-fb1ysr
Adding starcluster 0.94 to easy-install.pth file
Installing starcluster-script.py script to C:\Python27\Scripts
Installing starcluster.exe script to C:\Python27\Scripts
Installing starcluster.exe.manifest script to C:\Python27\Scripts

Installed c:\python27\lib\site-packages\starcluster-0.94-py2.7.egg
Processing dependencies for StarCluster
Searching for optcomplete>=1.2-devel
Reading http://pypi.python.org/simple/optcomplete/
Best match: optcomplete 1.2-devel
Downloading pypi.python.org/packages/source/o/optcomplete/optcomplete-1.2-
devel.tar.gz#md5=6392cd0a7154b3394004d5ad9d913d59
Processing optcomplete-1.2-devel.tar.gz
Running optcomplete-1.2-devel\setup.py -q bdist_egg --dist-dir 
c:\users\floris\appdata\local\temp\ea
sy_install-hbgocr\optcomplete-1.2-devel\egg-dist-tmp-ifrkgu
zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
No eggs found in c:\users\floris\appdata\local\temp\easy_install-hbgocr\optcomplete-
1.2-devel\egg-dist-tmp-ifrkgu (setup script problem?)
error: Could not find required distribution optcomplete>=1.2-devel

person user2825843    schedule 28.09.2013    source источник
comment
Яйца не найдены в c:\users\floris\appdata\local\temp\easy_install-hbgocr\optcomplete-1.2-devel\egg-dist-tmp-ifrkgu (проблема со сценарием установки?) Похоже, проблема с этим пакетом и сценарий easy_install дальше не идет.   -  person Finch_Powers    schedule 30.09.2013
comment
Вы нашли решение?   -  person Sergey Demyanov    schedule 09.10.2013


Ответы (1)


У меня была такая же проблема с easy_install. Мне помогла эта ссылка:

http://star.mit.edu/cluster/mlarchives/1942.html

В основном говорит использовать pip вместо easy_install

pip установить звездный кластер

Я нашел бинарные файлы pip, которые мне нужны для установки, здесь:

http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pip

С помощью pip все работало нормально.

person Giovanni    schedule 02.12.2013