Я пытаюсь настроить кластер R на AWS, используя StarCluster и более поздний AMI BioCoductor. Цель состоит в том, чтобы запустить некоторые параллельные вычисления на нескольких узлах с использованием снега.
Однако я уже в начале застрял в установке StarCluster на WINDOWS 7 64bit (вероятно, причина).
Что я сделал: (http://star.mit.edu/cluster/docs/latest/installation.html)
- Установите Python 2.7.5
- добавил каталог c:\Pyhton\Scripts в PATH (и даже перезапустил)
- установленный setuptools 0.6rc11
- крипто 2.3
- открыл приглашение CMD в c:\Python\Scripts и выполнил: easy_install StarCluster
Однако это заканчивается ошибкой. Похоже, он использует не те папки
У кого-нибудь есть идея?
C:\Python27\Scripts>easy_install StarCluster
Searching for StarCluster
Reading http://pypi.python.org/simple/StarCluster/
Best match: StarCluster 0.94
Downloading pypi.python.org/packages/source/S/StarCluster/StarCluster-
0.94.tar.gz#md5=982f59fde2a32b4bc059a497f5c0a0b7
Processing StarCluster-0.94.tar.gz
Running StarCluster-0.94\setup.py -q bdist_egg --dist-dir
c:\users\floris\appdata\local\temp\easy_in
stall-6bfhto\StarCluster-0.94\egg-dist-tmp-fb1ysr
Adding starcluster 0.94 to easy-install.pth file
Installing starcluster-script.py script to C:\Python27\Scripts
Installing starcluster.exe script to C:\Python27\Scripts
Installing starcluster.exe.manifest script to C:\Python27\Scripts
Installed c:\python27\lib\site-packages\starcluster-0.94-py2.7.egg
Processing dependencies for StarCluster
Searching for optcomplete>=1.2-devel
Reading http://pypi.python.org/simple/optcomplete/
Best match: optcomplete 1.2-devel
Downloading pypi.python.org/packages/source/o/optcomplete/optcomplete-1.2-
devel.tar.gz#md5=6392cd0a7154b3394004d5ad9d913d59
Processing optcomplete-1.2-devel.tar.gz
Running optcomplete-1.2-devel\setup.py -q bdist_egg --dist-dir
c:\users\floris\appdata\local\temp\ea
sy_install-hbgocr\optcomplete-1.2-devel\egg-dist-tmp-ifrkgu
zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
No eggs found in c:\users\floris\appdata\local\temp\easy_install-hbgocr\optcomplete-
1.2-devel\egg-dist-tmp-ifrkgu (setup script problem?)
error: Could not find required distribution optcomplete>=1.2-devel