глобалы и парфор

Из документации на parfor:

Тело цикла parfor не может содержать объявления глобальных или постоянных переменных.

В контексте вашей проблемы, то есть при вызове функции в parfor, которая, в свою очередь, ссылается на global, это означает: «parfor, вероятно, не даст ожидаемых или значимых результатов».

В этом есть смысл. Рассмотрим следующие

Lab 1:         Lab 2: 

GetB();        GetB();

если содержимое GetB() такое:

function GetB()
    global B;

    %# do something useful

    B = rand;

 end

какое значение будет у B, когда на него будет сделана ссылка на Lab 1? а на Lab 2? Как сообщаются о различных результатах rand? Будет беспорядок!

Написание кода, подходящего для parfor циклов, может быть настоящей проблемой, когда этот код исходит из чего-то, что имеет в виду только обычные for-циклы. Как правило, если вы заранее знаете, что собираетесь написать фрагмент кода Matlab с интенсивными вычислениями, с самого начала записывайте все функции и циклы как parfor циклы. Это единственный способ, при котором такие ошибки не будут стоить вам дня на перекодировку ваших функций.

Преобразование из for в parfor совсем не тривиально.

GLOBAL данные трудно использовать внутри PARFOR, потому что каждый рабочий процесс является отдельным процессом MATLAB, а глобальные переменные не синхронизируются от клиента (или любого другого процесса) с рабочими. Это сработает, если вы инициализируете глобальные данные из отдельной функции на воркерах. (Как указывает Роди, использование ключевого слова global непосредственно в теле цикла PARFOR не допускается, однако отдельные функции могут это делать). Итак, было бы законно сделать это:

parfor ii=1:matlabpool('size')
  myFcnWhichSetsUpGlobalData(); %# defines global OPTIONS
end
parfor ii=1:N
  result(ii) = myFcnWhichUsesGlobalData(); %# reads global OPTIONS
end

Я бы лично попытался удалить GLOBAL данные из вашего приложения - это улучшит его работу с PARFOR и сделает зависимости более понятными.

Еще один вариант для изучения - моя Worker Object Wrapper, разработанная чтобы вам не приходилось передавать данные рабочим несколько раз. Вы можете использовать это так:

options = buildOptions();
w_options = WorkerObjWrapper(options);
parfor ii=1:N
  result(ii) = myFcnNeedingOptions(ii, w_options.Value);
end