MediaStore - Uri для запроса всех типов файлов (медиа и немедиа)

Это "external" или "internal", хотя внутренние (системные файлы) здесь, вероятно, бесполезны.

ContentResolver cr = context.getContentResolver();
Uri uri = MediaStore.Files.getContentUri("external");

// every column, although that is huge waste, you probably need
// BaseColumns.DATA (the path) only.
String[] projection = null;

// exclude media files, they would be here also.
String selection = MediaStore.Files.FileColumns.MEDIA_TYPE + "="
        + MediaStore.Files.FileColumns.MEDIA_TYPE_NONE;
String[] selectionArgs = null; // there is no ? in selection so null here

String sortOrder = null; // unordered
Cursor allNonMediaFiles = cr.query(uri, projection, selection, selectionArgs, sortOrder);

Если вы хотите .pdf, только вы можете проверить mimetype

// only pdf
String selectionMimeType = MediaStore.Files.FileColumns.MIME_TYPE + "=?";
String mimeType = MimeTypeMap.getSingleton().getMimeTypeFromExtension("pdf");
String[] selectionArgsPdf = new String[]{ mimeType };
Cursor allPdfFiles = cr.query(uri, projection, selectionMimeType, selectionArgsPdf, sortOrder);